224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5786 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.51 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  40.31 
 
 		 220 aa  150  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  39.49 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  43.01 
 
 		 203 aa  148  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.81 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.8 
 
 		 203 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  38.07 
 
 		 213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  38.46 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  37.44 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.41 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  38.35 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  36.41 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  37.63 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.14 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  39.49 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5124  flavin reductase-like, FMN-binding  34 
 
 		 216 aa  128  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.178532 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  36.63 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  36.14 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2070  hypothetical protein  38.5 
 
 		 202 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.224794 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3465  hypothetical protein  37.43 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3110  hypothetical protein  37.43 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0966495  normal  0.11855 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  37.23 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.81 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  34.07 
 
 		 201 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  35.11 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  32.49 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  34.02 
 
 		 209 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  32 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  35.23 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.29 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  32.97 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  33.68 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.7 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  32 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  30.69 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  33.17 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.35 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  31 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  31 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  29.7 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  29.21 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  30.2 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  37.04 
 
 		 230 aa  99  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  31.21 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  29.17 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  35.71 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  37.27 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  31.96 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  32.99 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  33.68 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  36.67 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  32.14 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  33.7 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  34.13 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  33.11 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  33.11 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  31.96 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  30.88 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.5 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  30.88 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.44 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  30.88 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  31.87 
 
 		 201 aa  95.1  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  32.64 
 
 		 184 aa  95.5  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  34.3 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  31.96 
 
 		 203 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  34.38 
 
 		 209 aa  94.7  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  32.47 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  30.39 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  31.44 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  30.39 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  32.76 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  32.74 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  30.39 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  28.72 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.75 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  32.45 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  33.75 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  34.87 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  32.67 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  30 
 
 		 291 aa  91.3  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  33.12 
 
 		 209 aa  91.3  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  33.12 
 
 		 209 aa  91.3  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  33.12 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.11 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  32.58 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  29.71 
 
 		 292 aa  90.5  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.15 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.75 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  31.02 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  31.22 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  29.44 
 
 		 196 aa  89  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  32.89 
 
 		 209 aa  88.2  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  34.48 
 
 		 205 aa  88.2  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  29.65 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  33.12 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  30.41 
 
 		 203 aa  87.8  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>