200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0945 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  434  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  69.15 
 
 		 206 aa  298  3e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  45.85 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  43.2 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  41.33 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  42.35 
 
 		 203 aa  154  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  39.6 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  39.6 
 
 		 203 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  39.6 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  39.6 
 
 		 203 aa  151  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  39.6 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  39.11 
 
 		 203 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  39.6 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  39.11 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  38.61 
 
 		 203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  40.31 
 
 		 195 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.59 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  38.61 
 
 		 203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  39.8 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  38.61 
 
 		 203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  40.82 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  43.16 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  39.81 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5124  flavin reductase-like, FMN-binding  42.93 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.178532 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  40.5 
 
 		 231 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  39.57 
 
 		 204 aa  137  8.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  39.5 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  37.31 
 
 		 201 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  40.2 
 
 		 203 aa  134  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  37.81 
 
 		 205 aa  134  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  40.2 
 
 		 203 aa  133  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.91 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  39.46 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  37.31 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.29 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3465  hypothetical protein  43.6 
 
 		 202 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3110  hypothetical protein  43.6 
 
 		 202 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0966495  normal  0.11855 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.32 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  35.29 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2070  hypothetical protein  44.77 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.224794 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  41.94 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  40.46 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  38 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  36.82 
 
 		 202 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  33.8 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  37 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  38.42 
 
 		 203 aa  121  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.12 
 
 		 199 aa  121  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  40.7 
 
 		 203 aa  121  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  40.7 
 
 		 203 aa  121  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  40.54 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  38.67 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  35.44 
 
 		 228 aa  117  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  39.2 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.46 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.34 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  40.11 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  36.59 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  38.38 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  38.38 
 
 		 201 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.34 
 
 		 203 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  36.14 
 
 		 201 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.93 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02124  hypothetical protein  36.25 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  35.96 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  38.15 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  35.47 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  35.47 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  35.68 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2920  hypothetical protein  34.22 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  35.23 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  37.08 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  35.47 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  35.6 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  35.79 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  38.46 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  34.98 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.08 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  34.33 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  34.22 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  33.16 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  39.01 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  33.16 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  35.79 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  35.6 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  35.6 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  35.6 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  37.02 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.6 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  35.79 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  35.26 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  35.79 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  37.31 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  33.02 
 
 		 287 aa  100  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  36.32 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  32.8 
 
 		 241 aa  99.8  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  35.26 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  39.08 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  37.29 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>