179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3465 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3465  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3110  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0966495  normal  0.11855 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2070  hypothetical protein  94.06 
 
 		 202 aa  351  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.224794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  47.18 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  44.88 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  45.45 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  45.45 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.85 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  44.92 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  49.13 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  44.44 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  42.78 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  41.71 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  41.71 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.64 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  40.21 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.49 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  41.71 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.86 
 
 		 203 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  43.6 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  40.29 
 
 		 207 aa  131  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.7 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  37.43 
 
 		 208 aa  127  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  41.67 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  41.67 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  37.43 
 
 		 209 aa  121  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  45.19 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  38.66 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5124  flavin reductase-like, FMN-binding  36 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.178532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  43.7 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  36.07 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  36.82 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  36.82 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  37.11 
 
 		 209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  35.94 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  35.84 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  40.74 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  34.65 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  34.55 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  48.74 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.79 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  38.04 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  37.5 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  41.18 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  37.3 
 
 		 203 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  36.96 
 
 		 203 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  36.96 
 
 		 203 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  37.3 
 
 		 203 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  36.76 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  43.88 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  36.76 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  36.76 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 		 294 aa  105  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  36.76 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  36.71 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  42.96 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.73 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  35.68 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  35.48 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.47 
 
 		 295 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  39.75 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  34.66 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02124  hypothetical protein  38.97 
 
 		 169 aa  99  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  35.84 
 
 		 205 aa  98.2  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2920  hypothetical protein  32.83 
 
 		 202 aa  98.2  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  33.83 
 
 		 205 aa  97.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  40.29 
 
 		 205 aa  97.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  35.48 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  40 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  43.65 
 
 		 205 aa  96.3  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  34.78 
 
 		 202 aa  95.5  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  39.44 
 
 		 184 aa  95.9  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  37.42 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  43.31 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  34.44 
 
 		 201 aa  95.1  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.11 
 
 		 216 aa  94.7  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  39.57 
 
 		 209 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  36.77 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  39.74 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  38.97 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  32.58 
 
 		 292 aa  93.2  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  42.52 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  40.16 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  40.16 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  36.3 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  41.98 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  34.19 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.52 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  35.56 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  33.54 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  37.18 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  36.77 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  43.33 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.66 
 
 		 294 aa  92.8  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  41.22 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  37.5 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  34.41 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  40.98 
 
 		 230 aa  91.3  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  31.18 
 
 		 291 aa  91.3  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>