264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0259 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  100 
 
 		 189 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  81.48 
 
 		 189 aa  323  9e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  71.81 
 
 		 189 aa  290  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  71.81 
 
 		 190 aa  285  4e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  70.21 
 
 		 188 aa  282  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  68.09 
 
 		 189 aa  272  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.45 
 
 		 194 aa  238  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  60.43 
 
 		 200 aa  236  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  57.75 
 
 		 188 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  56.68 
 
 		 191 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  56.91 
 
 		 189 aa  231  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.98 
 
 		 192 aa  230  8.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.67 
 
 		 190 aa  228  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  56.38 
 
 		 190 aa  228  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.85 
 
 		 189 aa  225  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  55.85 
 
 		 190 aa  226  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.03 
 
 		 190 aa  224  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  54.79 
 
 		 190 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.6 
 
 		 195 aa  205  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  44.62 
 
 		 189 aa  182  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  42.78 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  39.77 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  38.3 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  38.62 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.08 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  38.17 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.25 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  34.83 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.79 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.22 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  35.36 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  37.1 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  32.78 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  32.73 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.32 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.98 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  29.45 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  29.45 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  26.2 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.32 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.43 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  28.76 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.92 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.26 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  32.84 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2559  hypothetical protein  26.67 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  29.45 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  28.83 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  30.66 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.8 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.57 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  27.78 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.29 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  31.16 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  28.81 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  27.59 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.95 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.78 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  28.47 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.39 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06060  conserved hypothetical protein  29.46 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  26.81 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2037  hypothetical protein  29.33 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.902665  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.66 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1553  hypothetical protein  29.1 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  39.6 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.95 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.9 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  38 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  22.6 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.13 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.27 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.87 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.13 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.76 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  31.97 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  31.29 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  24.44 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  25.16 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  28.97 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  25.97 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  31.29 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  29.89 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  25.15 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  25.7 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  23.73 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  27.74 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0361  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.76 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  30.61 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  25.79 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  23.98 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.29 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  27.33 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  24.58 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  28.47 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.42 
 
 		 294 aa  54.7  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>