More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2701 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  64.89 
 
 		 191 aa  257  7e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  58.51 
 
 		 189 aa  238  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  56.91 
 
 		 189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  56.08 
 
 		 190 aa  230  8.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  55.56 
 
 		 190 aa  230  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  55.32 
 
 		 188 aa  228  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  55.85 
 
 		 189 aa  225  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  56.38 
 
 		 192 aa  225  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  50 
 
 		 189 aa  218  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  54.26 
 
 		 200 aa  217  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.66 
 
 		 190 aa  216  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.38 
 
 		 189 aa  214  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  50.53 
 
 		 194 aa  213  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.13 
 
 		 190 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  52.15 
 
 		 188 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.38 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  46.03 
 
 		 190 aa  201  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  48.68 
 
 		 189 aa  201  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.03 
 
 		 195 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  41.82 
 
 		 209 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.36 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  38.1 
 
 		 216 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.41 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  36.9 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  36.61 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  37.43 
 
 		 200 aa  124  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  33.89 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  34.66 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  34.57 
 
 		 186 aa  110  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  35.71 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  34.29 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.26 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.59 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.57 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.98 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  32 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  31.68 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  31.68 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.56 
 
 		 160 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  31.51 
 
 		 176 aa  85.1  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.11 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.58 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.14 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  29.23 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.87 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  31.5 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  32.58 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  29.77 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  30.07 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  29.41 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  31.06 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.14 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.89 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  29.87 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  27.89 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  35.29 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  37.01 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  29.79 
 
 		 205 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  35.54 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  32.7 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  27.88 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06661  hypothetical protein  30.56 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  32.54 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  28.46 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  28.74 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2037  hypothetical protein  27.33 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.902665  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  32.12 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.88 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  28.77 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  26.06 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  28.47 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.37 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.45 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.52 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  28.95 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  22.75 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.68 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.77 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  26.32 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  30.95 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  28.34 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  29.53 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  36.46 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  30.88 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.46 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.93 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  27 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  31.34 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  31.34 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.37 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  31.34 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  23.76 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  24.1 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  27.94 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0726  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.47 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.09 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  25.71 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>