130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0437 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
185 aa  374  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  48.11 
 
 
185 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  45.95 
 
 
186 aa  171  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.08 
 
 
186 aa  159  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  47.92 
 
 
165 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  42.62 
 
 
186 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  47.49 
 
 
184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  39.27 
 
 
216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  39.36 
 
 
189 aa  132  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.71 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.18 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.2 
 
 
190 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  33.16 
 
 
200 aa  95.9  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.56 
 
 
190 aa  95.9  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.95 
 
 
194 aa  95.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  31.77 
 
 
191 aa  92  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  34.76 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.48 
 
 
193 aa  86.3  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.39 
 
 
190 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 
209 aa  85.5  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  34.44 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.46 
 
 
195 aa  84.3  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  31.28 
 
 
189 aa  84.3  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.85 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  30.23 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  30.05 
 
 
190 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.58 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  31.61 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.67 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  28.42 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  31.13 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  28.73 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.48 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.27 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.25 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  28.26 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  29.1 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  28.86 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  28.86 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  28.77 
 
 
200 aa  67  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25 
 
 
160 aa  61.2  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  25.97 
 
 
202 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  26.14 
 
 
205 aa  58.2  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  25 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.39 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.03 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  23.75 
 
 
183 aa  56.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.5 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  25 
 
 
176 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.86 
 
 
192 aa  55.5  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  25.36 
 
 
176 aa  55.5  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  26.71 
 
 
180 aa  54.7  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  26.9 
 
 
182 aa  54.7  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  25.58 
 
 
180 aa  54.3  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  25.42 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  24.03 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.18 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  25.58 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  26.63 
 
 
187 aa  52.4  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  26.7 
 
 
192 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.95 
 
 
189 aa  51.2  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  23.97 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  27.08 
 
 
192 aa  50.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  23.88 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  23.91 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  25.99 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.14 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  25.14 
 
 
194 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.19 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  23.5 
 
 
226 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  26.14 
 
 
194 aa  48.5  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.89 
 
 
168 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  25 
 
 
196 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  25 
 
 
196 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  26.79 
 
 
169 aa  47.8  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  25 
 
 
196 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  22.16 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  25.28 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  22.16 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  22.16 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  23.2 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.74 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  22.46 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  24.18 
 
 
199 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  27.59 
 
 
292 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  23.94 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  24.14 
 
 
197 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  26.98 
 
 
313 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  25.17 
 
 
185 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.35 
 
 
233 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  23.12 
 
 
207 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  21.14 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  20.57 
 
 
194 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.26 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  25.25 
 
 
203 aa  45.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  22.58 
 
 
207 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  25.18 
 
 
186 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  24.03 
 
 
168 aa  45.1  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  24.58 
 
 
218 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>