176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4048 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  471  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  67.31 
 
 		 233 aa  302  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  54.46 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0926  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.76 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  normal  0.0485806 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5225  hypothetical protein  56.37 
 
 		 242 aa  208  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.408717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2891  hypothetical protein  53.92 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4803  hypothetical protein  52.94 
 
 		 244 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3365  hypothetical protein  52.94 
 
 		 244 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4151  hypothetical protein  52.45 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.807728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3299  hypothetical protein  52.94 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0091  hypothetical protein  51.63 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121116 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4625  hypothetical protein  47.64 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5960  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.03 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1051  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  49.48 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.136443 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0925  hypothetical protein  32.52 
 
 		 198 aa  133  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339303  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1414  hypothetical protein  36.98 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1997  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.36 
 
 		 185 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.418492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2620  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.81 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.592321  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1355  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.11 
 
 		 196 aa  99  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.56 
 
 		 196 aa  95.9  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.56 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  28.27 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.85 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.79 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2920  hypothetical protein  28.41 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.98 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  32.76 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  29.83 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  30.5 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  31.07 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  31.25 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.34 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  27.07 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.12 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  29.26 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  30 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  30.89 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  30.13 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  30.13 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  29.24 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  27.47 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  30.43 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  28.66 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  32.89 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  34.59 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.52 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  25.97 
 
 		 189 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  34.59 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.68 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  31.08 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  28.57 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  30.07 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  30 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.82 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  29.19 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  27.27 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  25.67 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.88 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  30.63 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.55 
 
 		 123 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  27.65 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  26.46 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  30.08 
 
 		 180 aa  52.8  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.45 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  30.72 
 
 		 186 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  34.94 
 
 		 185 aa  51.6  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  31.1 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  26.88 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  30.05 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.75 
 
 		 180 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  29.38 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  27.98 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.87 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  32.7 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.32 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  28.07 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  23.53 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  32.7 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  32.7 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  28.87 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  28.87 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  28.87 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  31.97 
 
 		 177 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  28.65 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.4 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  24.09 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  27.78 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  30.3 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  31.08 
 
 		 176 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  29.52 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  25.18 
 
 		 187 aa  49.7  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  27.06 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0511  hypothetical protein  20.97 
 
 		 253 aa  49.3  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.17 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  28.41 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  28.87 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.5 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  25.14 
 
 		 190 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.35 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  28.16 
 
 		 189 aa  48.9  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>