137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1739 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
180 aa  373  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  76.67 
 
 
180 aa  299  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  65.56 
 
 
180 aa  268  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  67.78 
 
 
180 aa  267  5.9999999999999995e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  66.11 
 
 
180 aa  261  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  65.36 
 
 
180 aa  258  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  63.33 
 
 
185 aa  247  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.32 
 
 
176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  46.02 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  43.43 
 
 
176 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  44.89 
 
 
178 aa  155  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  44.32 
 
 
177 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  46.02 
 
 
185 aa  153  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  42.29 
 
 
182 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  45.45 
 
 
178 aa  148  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  39.08 
 
 
186 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  39.66 
 
 
177 aa  144  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  38.55 
 
 
188 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.59 
 
 
186 aa  141  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.85 
 
 
189 aa  134  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  38.64 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.07 
 
 
186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.87 
 
 
185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
185 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.68 
 
 
123 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  37.18 
 
 
160 aa  98.6  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  31.41 
 
 
202 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  30.98 
 
 
208 aa  87.4  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  31.91 
 
 
199 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.47 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  27.37 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  30.6 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.67 
 
 
160 aa  80.5  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.28 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.66 
 
 
215 aa  77  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  36.75 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  31.11 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  25.71 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.49 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.71 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.49 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.52 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  31.95 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.54 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  27.93 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.93 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  29.07 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  34.45 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  29.07 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.65 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.45 
 
 
195 aa  67.8  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  27.91 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  27.91 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  27.91 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  27.91 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.77 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  32.5 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.77 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.88 
 
 
189 aa  62  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  29.73 
 
 
200 aa  62  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  24.57 
 
 
204 aa  62  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  28.17 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  28.17 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  28.31 
 
 
195 aa  61.6  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  29.41 
 
 
189 aa  61.6  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  33.93 
 
 
190 aa  60.8  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  31.09 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
200 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  25.9 
 
 
188 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.25 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.97 
 
 
190 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1997  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.95 
 
 
185 aa  54.7  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.418492  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 
192 aa  54.7  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
180 aa  54.7  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.2 
 
 
190 aa  54.3  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  27.27 
 
 
162 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  25.66 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.52 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.62 
 
 
186 aa  52  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  27.69 
 
 
185 aa  52  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  27.14 
 
 
216 aa  51.6  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  29.75 
 
 
226 aa  51.6  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.68 
 
 
215 aa  51.6  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  28.03 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  27.59 
 
 
189 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  26.02 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.39 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  27.27 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  26.56 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.59 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  27.68 
 
 
184 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.19 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.25 
 
 
189 aa  48.9  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  27.62 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1531  hypothetical protein  30 
 
 
162 aa  48.9  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  25.22 
 
 
205 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  36.11 
 
 
214 aa  48.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1404  putative flavoredoxin  32.41 
 
 
178 aa  48.5  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  29.41 
 
 
189 aa  48.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 
190 aa  47.8  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>