199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2311 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
180 aa  367  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  82.22 
 
 
180 aa  316  9e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  78.33 
 
 
181 aa  301  4.0000000000000003e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  78.21 
 
 
186 aa  295  2e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  40.24 
 
 
183 aa  108  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  40.48 
 
 
177 aa  104  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  36.36 
 
 
177 aa  95.9  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  32.14 
 
 
178 aa  94.4  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  34.51 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.37 
 
 
197 aa  90.1  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  30.23 
 
 
208 aa  89  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  35.26 
 
 
194 aa  89  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  39.68 
 
 
199 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.1 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.16 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.16 
 
 
225 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  31.62 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  35.62 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.66 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  26.04 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  26.04 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  28.4 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  29.17 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.74 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.27 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.09 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.61 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.21 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.62 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  36.51 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  35.83 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.68 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.21 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  26.79 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.07 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  25.2 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.01 
 
 
186 aa  72  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  28.47 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  31.11 
 
 
168 aa  72  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.79 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  25.74 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.8 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
190 aa  70.9  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  35.09 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.14 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.09 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  32.87 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  27.21 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  32.32 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  32.32 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  32.32 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.32 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  32.32 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  31.71 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  25.31 
 
 
195 aa  67.8  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  31.17 
 
 
198 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0723  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  31.85 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  27.88 
 
 
190 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  31.1 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  30.12 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  34.21 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.03 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.29 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  31.25 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  25.87 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.59 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  33.57 
 
 
248 aa  64.7  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  31.82 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  31.62 
 
 
244 aa  63.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  25.66 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.61 
 
 
216 aa  60.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  33.09 
 
 
192 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.62 
 
 
123 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.42 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.49 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  28.97 
 
 
160 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  29.48 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.46 
 
 
180 aa  58.9  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  32.12 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  30 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  25.29 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  28.77 
 
 
200 aa  58.9  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  25.99 
 
 
180 aa  57.8  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  26.35 
 
 
189 aa  57.8  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.86 
 
 
190 aa  57.8  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  26.67 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.15 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  26.59 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  27.06 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.19 
 
 
215 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  22.48 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  21.39 
 
 
185 aa  55.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  29.48 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  28.23 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.13 
 
 
190 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  28.74 
 
 
196 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  28.74 
 
 
196 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>