113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0720 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
195 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  77.08 
 
 
192 aa  316  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  71.2 
 
 
201 aa  288  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  71.2 
 
 
201 aa  288  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  71.2 
 
 
201 aa  288  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  69.43 
 
 
194 aa  280  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  70.05 
 
 
196 aa  274  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  70.05 
 
 
196 aa  274  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  70.59 
 
 
194 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  71.12 
 
 
192 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  70.59 
 
 
189 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  70.05 
 
 
196 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  68.45 
 
 
192 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  65.64 
 
 
197 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  63.92 
 
 
194 aa  264  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  66.32 
 
 
198 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  65.41 
 
 
194 aa  261  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  53 
 
 
202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  53.4 
 
 
205 aa  198  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.97 
 
 
215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  51.04 
 
 
199 aa  191  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.73 
 
 
225 aa  187  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.73 
 
 
193 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  48.17 
 
 
208 aa  179  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  42.39 
 
 
195 aa  157  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  45.98 
 
 
194 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  42.25 
 
 
194 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.39 
 
 
194 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  40.96 
 
 
204 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  42.02 
 
 
189 aa  144  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.02 
 
 
189 aa  143  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  40.96 
 
 
189 aa  141  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  40.96 
 
 
189 aa  141  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  40.96 
 
 
189 aa  141  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  41.49 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  40.43 
 
 
189 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1268  flavin reductase domain-containing protein  67.39 
 
 
118 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.131105 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.65 
 
 
192 aa  131  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  36.65 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.16 
 
 
197 aa  94.7  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  32.4 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  28.11 
 
 
177 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  29.03 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.05 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.04 
 
 
160 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  27.53 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  27.93 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  32.6 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  26.88 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  27.54 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.99 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.09 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.78 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  28.79 
 
 
248 aa  64.7  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.78 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  27.57 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  21.39 
 
 
244 aa  63.2  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.79 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.05 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  30.64 
 
 
180 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  25.41 
 
 
185 aa  62  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  27.32 
 
 
180 aa  62  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  27.98 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  26.46 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  32.89 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.86 
 
 
195 aa  59.7  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  28.11 
 
 
186 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  26.95 
 
 
192 aa  58.9  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.94 
 
 
194 aa  58.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.01 
 
 
215 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  26.62 
 
 
188 aa  58.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.98 
 
 
185 aa  57.8  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  25.66 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  24.86 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  28.74 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.8 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  28.57 
 
 
187 aa  56.2  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  28.18 
 
 
183 aa  55.5  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  25 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.25 
 
 
190 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  29.24 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  27.01 
 
 
180 aa  54.7  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  28.96 
 
 
189 aa  51.6  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  25.86 
 
 
184 aa  51.2  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  20.38 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  25.4 
 
 
185 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.26 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  27.75 
 
 
186 aa  48.9  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  22.86 
 
 
393 aa  48.5  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  26.29 
 
 
191 aa  48.5  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  27.89 
 
 
186 aa  48.5  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.24 
 
 
215 aa  48.5  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.65 
 
 
185 aa  48.5  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.03 
 
 
186 aa  48.5  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  29.75 
 
 
190 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  26.06 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  23.98 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.5 
 
 
190 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>