182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0401 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  77.65 
 
 		 181 aa  298  4e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  78.77 
 
 		 180 aa  298  4e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  78.21 
 
 		 180 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  39.16 
 
 		 177 aa  111  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  37.95 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  29.48 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.53 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  34.81 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.71 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  34.39 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  32.07 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.54 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.33 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  32.39 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  28.47 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  33.85 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  32.32 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.32 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  32.12 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  32.32 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  31.82 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  27.54 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  32.32 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  32.28 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.86 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  32.32 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  31.1 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  31.71 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.7 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  31.18 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.09 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  30.12 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0723  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  29.63 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.17 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  27.08 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  29.41 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.17 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.78 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  27.41 
 
 		 185 aa  62  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.19 
 
 		 168 aa  62  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  30.54 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  30.56 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  28.78 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.53 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.24 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.4 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.06 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.47 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  22.49 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  22.49 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.87 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.78 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.41 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.39 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  33.11 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  31.36 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  31.3 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  27.78 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  30 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.77 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  24.09 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  31.93 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  30.83 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  26.39 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  30.26 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  25.45 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  28.8 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  25.6 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  30.46 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  31.75 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  24.39 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  26.06 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.59 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.65 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.74 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.81 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  25.55 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  30.72 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.74 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.33 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.46 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6112  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  24.83 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  30.64 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  31.21 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.38 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  23.46 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  28.35 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  33.57 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2309  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase coupling protein  25 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.78 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.6 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.32 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  31.03 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>