162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2046 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  71.51 
 
 
192 aa  251  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  59.28 
 
 
194 aa  225  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  60 
 
 
189 aa  222  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  60 
 
 
189 aa  222  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  60 
 
 
189 aa  222  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  59.46 
 
 
189 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  59.46 
 
 
189 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  60.53 
 
 
190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  59.46 
 
 
189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  59.46 
 
 
189 aa  218  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  53.16 
 
 
205 aa  211  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.17 
 
 
215 aa  206  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  52.08 
 
 
208 aa  203  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  51.27 
 
 
202 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  51.4 
 
 
199 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.6 
 
 
225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.6 
 
 
193 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.13 
 
 
194 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  46.6 
 
 
204 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  46.55 
 
 
195 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  50.57 
 
 
197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  46.99 
 
 
189 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.62 
 
 
192 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  47.7 
 
 
196 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  48.28 
 
 
196 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  48.28 
 
 
196 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  43.85 
 
 
192 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  42.93 
 
 
194 aa  165  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  45.41 
 
 
192 aa  164  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  44.86 
 
 
194 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  43.75 
 
 
194 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  43.75 
 
 
194 aa  157  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  43.72 
 
 
201 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  43.72 
 
 
201 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  43.72 
 
 
201 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.98 
 
 
195 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  41.76 
 
 
198 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.97 
 
 
197 aa  118  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  39.34 
 
 
176 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  36.76 
 
 
176 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  34.95 
 
 
177 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  34.27 
 
 
178 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.05 
 
 
176 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.98 
 
 
180 aa  99  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  36.42 
 
 
177 aa  98.6  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.78 
 
 
186 aa  98.6  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  33.89 
 
 
178 aa  95.9  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  31.79 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.38 
 
 
185 aa  92.4  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35 
 
 
160 aa  89  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.98 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  34.08 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  31.52 
 
 
188 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  33.74 
 
 
183 aa  85.1  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  40.74 
 
 
180 aa  84.7  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  32.94 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  29.94 
 
 
184 aa  84.7  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.07 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.02 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  29.26 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.1 
 
 
195 aa  82  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  31.64 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  29.1 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  28.47 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.94 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  29.83 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1268  flavin reductase domain-containing protein  42.31 
 
 
118 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.131105 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  31.41 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  27.68 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.29 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.93 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  30.57 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  31.95 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  26.9 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  31.21 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  30.28 
 
 
160 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  27.22 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  27.22 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  28.44 
 
 
149 aa  62.8  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  28.44 
 
 
149 aa  62.8  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  27.67 
 
 
168 aa  62.4  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  26.28 
 
 
209 aa  62  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1255  flavin reductase domain-containing protein  29.41 
 
 
216 aa  61.2  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.46 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  31.97 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.88 
 
 
189 aa  59.7  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  29.52 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.07 
 
 
123 aa  59.3  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0319  flavin reductase domain protein FMN-binding  30 
 
 
183 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.42584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  25.38 
 
 
162 aa  57.8  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  22.73 
 
 
167 aa  57.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  28.26 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.06 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0224  FMN-binding protein  28.17 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114733  normal  0.756324 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.71 
 
 
215 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.72 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  26.14 
 
 
169 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>