131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2194 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  99.47 
 
 
189 aa  390  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  99.47 
 
 
189 aa  390  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  99.47 
 
 
189 aa  390  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
189 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  97.35 
 
 
189 aa  384  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  96.83 
 
 
189 aa  384  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  95.77 
 
 
189 aa  380  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  81.38 
 
 
190 aa  325  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  58.64 
 
 
194 aa  237  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  59.46 
 
 
194 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  60.96 
 
 
192 aa  213  9e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  47.94 
 
 
205 aa  188  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  50 
 
 
215 aa  187  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  49.21 
 
 
202 aa  185  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  46.28 
 
 
199 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  44.97 
 
 
208 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.96 
 
 
225 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.96 
 
 
193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  42.78 
 
 
195 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.78 
 
 
194 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  40.22 
 
 
204 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  41.58 
 
 
197 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  40.53 
 
 
189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  41.49 
 
 
196 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  41.49 
 
 
196 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  40.96 
 
 
196 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  40.96 
 
 
194 aa  141  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  40.96 
 
 
192 aa  141  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  41.76 
 
 
194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.43 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.95 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  41.21 
 
 
194 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  39.15 
 
 
192 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  36.76 
 
 
194 aa  131  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  37.89 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  37.89 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  37.89 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  40.43 
 
 
198 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.97 
 
 
197 aa  97.1  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  30.73 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  30.39 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.78 
 
 
180 aa  82  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  28.42 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.89 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.75 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  32.6 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.33 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  31.03 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  27.22 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.12 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  34.88 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  28.49 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.74 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  29.19 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  30.11 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  28.33 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.54 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  28.07 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  29.6 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  28.98 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.96 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  29.78 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  35.33 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.46 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  38.46 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1268  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.131105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  28.07 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.91 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  31.71 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.89 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.48 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.08 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  29.17 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  28.66 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  25.4 
 
 
185 aa  62.4  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  33.11 
 
 
189 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.04 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  31.29 
 
 
189 aa  61.6  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.03 
 
 
189 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  25.43 
 
 
182 aa  61.2  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  36.21 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.85 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  35.79 
 
 
149 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  35.79 
 
 
149 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  34.69 
 
 
216 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.35 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  29.93 
 
 
164 aa  58.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.34 
 
 
215 aa  58.2  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.34 
 
 
189 aa  57.8  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  31.3 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  26.35 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  31.29 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  30.91 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  33.05 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  29.17 
 
 
186 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  30.71 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  25.77 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  25.77 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.03 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>