220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5713 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 		 189 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  70.56 
 
 		 186 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  69.61 
 
 		 186 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  66.11 
 
 		 188 aa  261  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  58.38 
 
 		 186 aa  248  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.35 
 
 		 185 aa  212  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  53.41 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  50 
 
 		 178 aa  191  7e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  73.11 
 
 		 123 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  48.86 
 
 		 177 aa  185  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.55 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  46.59 
 
 		 184 aa  177  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  47.34 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  47.13 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  44.44 
 
 		 176 aa  170  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  46.51 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.68 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  42.5 
 
 		 182 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  41.38 
 
 		 180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  39.18 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.76 
 
 		 180 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  43.75 
 
 		 160 aa  135  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.85 
 
 		 180 aa  134  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  38.98 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  35.23 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  38.64 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  31.52 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.84 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.88 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.84 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  32.11 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.03 
 
 		 186 aa  99.4  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  34.07 
 
 		 202 aa  98.6  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.67 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.93 
 
 		 215 aa  95.9  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  31.09 
 
 		 199 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  29.47 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  35.91 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  39.23 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  30.17 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  30 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  30.98 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  36.5 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  32.39 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  26.54 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  32.75 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  32.75 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  32.75 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  33.58 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  33.58 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  32.75 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  32.87 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  27.37 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.33 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  31.28 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  31.4 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  32.16 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  32.16 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  29.28 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.372543 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.58 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.33 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  28.18 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  28.09 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  28.18 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.53 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.25 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  27.62 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.82 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.14 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  27.94 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.81 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  30 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  24.18 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.84 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  30.57 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  25.93 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  28.68 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  27.01 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  25.41 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  25 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  25 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  29.77 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  28.68 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  29.94 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  29.94 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.7 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  27.41 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.6 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  29.11 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  24.26 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  29.5 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  29.37 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.78 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  28.68 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  31.93 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.08 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  28.3 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>