216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2510 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 		 186 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  77.42 
 
 		 186 aa  303  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  70.43 
 
 		 188 aa  284  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  70.56 
 
 		 189 aa  275  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  58.01 
 
 		 186 aa  241  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.78 
 
 		 185 aa  238  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  56.91 
 
 		 185 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  83.19 
 
 		 123 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  51.7 
 
 		 178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  50 
 
 		 184 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  48.3 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  49.43 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  47.13 
 
 		 176 aa  177  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.13 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  46.78 
 
 		 176 aa  174  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  45.93 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.85 
 
 		 180 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  42.94 
 
 		 180 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  41.04 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.56 
 
 		 180 aa  142  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  41.92 
 
 		 182 aa  141  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  38.07 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  39.2 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  38.64 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.07 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  43.04 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  32.31 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  32.78 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  32.42 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  31.91 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.85 
 
 		 215 aa  95.5  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.35 
 
 		 195 aa  95.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  31.46 
 
 		 208 aa  94.7  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.2 
 
 		 225 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.07 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.2 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  33.7 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  34.25 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  34.25 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.11 
 
 		 192 aa  85.1  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  34.56 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.88 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  27.68 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  31.21 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  29.89 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  29.89 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.14 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  30.64 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  29.31 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  32.81 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  27.67 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.68 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  28.09 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.74 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  31.43 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  29.48 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  29.55 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  29.55 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  27.74 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.46 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  28.25 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  29.55 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  28.98 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.78 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  26.28 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  27.78 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  27.78 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.07 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  30.22 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.07 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.99 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  26.19 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  24.82 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  31.74 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  29.71 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  29.13 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  32.62 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  28 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  23.19 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.91 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  29.17 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.98 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  31.85 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  31.25 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.41 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.46 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  28.03 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  24.47 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0224  FMN-binding protein  28.68 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114733  normal  0.756324 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.25 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  31.54 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  30.23 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  26.87 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  30.17 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  28.03 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>