195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3970 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
225 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
193 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  59.14 
 
 
194 aa  230  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  58.38 
 
 
195 aa  227  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  56.04 
 
 
204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  56.52 
 
 
205 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.21 
 
 
215 aa  211  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  53.16 
 
 
208 aa  210  9e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  53.55 
 
 
199 aa  208  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  51.89 
 
 
194 aa  202  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.72 
 
 
192 aa  200  9e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  54.35 
 
 
192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  52.15 
 
 
196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  52.15 
 
 
196 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  52.15 
 
 
196 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  54.64 
 
 
189 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  53.01 
 
 
202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  51.89 
 
 
194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  50.53 
 
 
197 aa  195  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  52.6 
 
 
194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  50.81 
 
 
198 aa  194  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  53.8 
 
 
194 aa  194  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  52.72 
 
 
194 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  50.27 
 
 
192 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.73 
 
 
195 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  50.27 
 
 
201 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  50.27 
 
 
201 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  50.27 
 
 
201 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.11 
 
 
192 aa  174  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  46.07 
 
 
194 aa  171  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  44.51 
 
 
189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  45.05 
 
 
189 aa  165  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  43.96 
 
 
189 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  43.96 
 
 
189 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  43.96 
 
 
189 aa  164  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  45.05 
 
 
189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  45.25 
 
 
190 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  43.96 
 
 
189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  36.72 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  36.11 
 
 
178 aa  115  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  34.25 
 
 
176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  35.39 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  35 
 
 
176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.36 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  34.97 
 
 
177 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1268  flavin reductase domain-containing protein  45 
 
 
118 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.131105 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.84 
 
 
189 aa  101  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  35.06 
 
 
185 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.78 
 
 
185 aa  94  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  30.9 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.2 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  30.17 
 
 
184 aa  92.4  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  31.03 
 
 
185 aa  91.3  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.87 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  32.04 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  32.14 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.93 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.32 
 
 
160 aa  87.8  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.1 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  27.84 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.11 
 
 
195 aa  84  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  31.61 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.12 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  33.57 
 
 
160 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  35.5 
 
 
181 aa  80.9  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  32.75 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  31.76 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  40 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  31.07 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  31.03 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  33.53 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.49 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  28 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  31.36 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.57 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
195 aa  67.8  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.1 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  26.11 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  26.71 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  27.78 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.25 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  28.68 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0319  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.54 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.42584 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0311  hypothetical protein  28.79 
 
 
160 aa  62.8  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0535887  decreased coverage  0.000000645484 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  27.66 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.79 
 
 
190 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.66 
 
 
259 aa  61.6  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  35.11 
 
 
177 aa  61.2  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  31.25 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  29.23 
 
 
162 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  31.25 
 
 
168 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.08 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  30.13 
 
 
189 aa  57.8  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.32 
 
 
167 aa  57.4  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.32 
 
 
168 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  25.95 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  29.63 
 
 
216 aa  55.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1255  flavin reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
216 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.35 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>