172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5217 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 182 aa  374  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  58.56 
 
 		 185 aa  228  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  52 
 
 		 176 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  48.57 
 
 		 176 aa  193  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  50.86 
 
 		 176 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  47.73 
 
 		 177 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  49.11 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  46.75 
 
 		 178 aa  174  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  47.43 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  47.34 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  45.62 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  43.43 
 
 		 180 aa  152  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.71 
 
 		 180 aa  151  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.29 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.29 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  42.69 
 
 		 188 aa  147  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  44.79 
 
 		 185 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  41.14 
 
 		 180 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.53 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.5 
 
 		 189 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.92 
 
 		 186 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.87 
 
 		 186 aa  139  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  40.57 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  39.24 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  40.38 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.81 
 
 		 123 aa  95.1  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.04 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.04 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.86 
 
 		 197 aa  88.2  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.98 
 
 		 160 aa  87.8  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  30.05 
 
 		 202 aa  86.3  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  30.98 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  28.34 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  28.26 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.39 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.08 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.57 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  29.83 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  30 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.09 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.95 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.44 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  29.94 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  29.44 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  29.44 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.99 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  22.86 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  26.79 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  26.84 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  30.34 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  24.87 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  32.11 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0685  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  31.86 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.957986 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  27.54 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.89 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.57 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.74 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  25.43 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  25.43 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  25.43 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  30.95 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  27.33 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  25.43 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  26.67 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  25.57 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  30.15 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  26.01 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.01 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  27.01 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  27.12 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  26.85 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.74 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  31.34 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.9 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  27.01 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  27.01 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  30.28 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  31.34 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.3 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.93 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  26.7 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.9 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  26.71 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  28.36 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  24.73 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  25.56 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  25.56 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  19.74 
 
 		 167 aa  54.3  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1531  hypothetical protein  36.84 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  25.6 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  25.56 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  27.22 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  24.31 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1050  hypothetical protein  26.01 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  23.87 
 
 		 244 aa  52.8  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.83 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>