221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3753 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 		 186 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  77.42 
 
 		 188 aa  313  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  77.42 
 
 		 186 aa  303  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  69.61 
 
 		 189 aa  266  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  60.44 
 
 		 186 aa  244  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  60.56 
 
 		 185 aa  238  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  58.89 
 
 		 185 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  50.85 
 
 		 178 aa  204  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  79.83 
 
 		 123 aa  200  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  51.12 
 
 		 184 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  49.41 
 
 		 178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  48.86 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.28 
 
 		 176 aa  190  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  46.55 
 
 		 176 aa  185  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  45.83 
 
 		 176 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  46.43 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.35 
 
 		 180 aa  164  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  41.95 
 
 		 180 aa  157  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  44.12 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  45.62 
 
 		 182 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.02 
 
 		 180 aa  150  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  43.53 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.08 
 
 		 180 aa  147  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  36.93 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  44.65 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  39.2 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.31 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  31.84 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  34.07 
 
 		 202 aa  98.6  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.38 
 
 		 215 aa  96.3  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.9 
 
 		 193 aa  93.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.9 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.76 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  31.79 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  31.52 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.24 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.76 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  36.09 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  31.49 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  29.41 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.41 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  28.26 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  33.57 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  33.09 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  31.03 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  31.03 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.25 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  33.09 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  33.09 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.99 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  31.11 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  26.38 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.46 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.47 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  26.62 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  30.48 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  26.67 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  32.67 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  22.98 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  32.86 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  35.71 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.71 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  30.5 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  25.74 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  32.14 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  35 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  33.09 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  32.14 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  35 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  30.94 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.92 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  28.98 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  28.98 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  33.09 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  27.92 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  27.92 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  29.55 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0224  FMN-binding protein  36.17 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114733  normal  0.756324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  31.21 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  33.57 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  32.37 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  28.36 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  33.57 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  28.09 
 
 		 198 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  24.26 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.36 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  29.3 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  27.01 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  28.41 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  29.93 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  24.48 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  32.74 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.97 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  30.65 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>