124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1289 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 		 123 aa  256  7e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  83.19 
 
 		 186 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  79.83 
 
 		 186 aa  200  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  77.97 
 
 		 188 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  73.11 
 
 		 189 aa  186  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  60 
 
 		 185 aa  158  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.14 
 
 		 186 aa  150  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  53.78 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  52.78 
 
 		 178 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  52.21 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  52.17 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  48.7 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  49.57 
 
 		 176 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  46.43 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.35 
 
 		 176 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  47.79 
 
 		 177 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.49 
 
 		 180 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  42.98 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.49 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  44.34 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  46.49 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  42.11 
 
 		 185 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.68 
 
 		 180 aa  100  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  97.4  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  41.38 
 
 		 180 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  43.81 
 
 		 182 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.37 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  45.57 
 
 		 209 aa  67  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  33.85 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.25 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.51 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  34.11 
 
 		 199 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.31 
 
 		 215 aa  63.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  36.36 
 
 		 208 aa  60.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  33.07 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.52 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  30.53 
 
 		 181 aa  57  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  33.33 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  35.24 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  33.72 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  33.72 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0091  hypothetical protein  34.91 
 
 		 233 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121116 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  28.44 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.47 
 
 		 197 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  32.61 
 
 		 195 aa  53.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  30 
 
 		 180 aa  52.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  34.55 
 
 		 226 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  33.9 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  32.54 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.33 
 
 		 215 aa  52.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1050  hypothetical protein  28.92 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  34.62 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  34.62 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.05 
 
 		 233 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.1 
 
 		 168 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  27.59 
 
 		 195 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.8 
 
 		 215 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  29.31 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  32.26 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  32.26 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  32.26 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.59 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  32.26 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0224  FMN-binding protein  35.53 
 
 		 203 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114733  normal  0.756324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  31.45 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.48 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  34.67 
 
 		 189 aa  47.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  36.11 
 
 		 189 aa  47.4  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  27.47 
 
 		 192 aa  46.2  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.14 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.98 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.17 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  30.58 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4803  hypothetical protein  30.48 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  29.73 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3365  hypothetical protein  30.48 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.11 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  34.83 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.11 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.49 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.82 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.88 
 
 		 203 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1531  hypothetical protein  35.09 
 
 		 162 aa  43.5  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  43.1 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  34.72 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  31.71 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4151  hypothetical protein  34.72 
 
 		 234 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.807728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.53 
 
 		 223 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.88 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.67 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  30.34 
 
 		 241 aa  42  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  32.89 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  35.56 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0361  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.71 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  32.35 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0420  hypothetical protein  30.12 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0595779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  36.67 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>