269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1226 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  58.85 
 
 		 244 aa  323  1e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.29 
 
 		 185 aa  129  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.22 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  39.52 
 
 		 183 aa  97.8  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  33.78 
 
 		 192 aa  89  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.2 
 
 		 186 aa  86.7  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  29.59 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  34.38 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.12 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  31.21 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  31.13 
 
 		 162 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  26.09 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.07 
 
 		 195 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.54 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  27.54 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.35 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  29.93 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.25 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  25.44 
 
 		 192 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  25.44 
 
 		 192 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2008  hypothetical protein  31.54 
 
 		 160 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  26.16 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.09 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.98 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.71 
 
 		 189 aa  62  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  30 
 
 		 189 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.18 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.08 
 
 		 159 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  26.9 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  34.42 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  33.06 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  33.11 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  28.36 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  27.1 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  31.21 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  29.24 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  27.27 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.59 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  30.37 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.39 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.37 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  28.07 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09651  hypothetical protein  27.41 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  29.71 
 
 		 188 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  25.58 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.07 
 
 		 190 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14951  hypothetical protein  29.86 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.431741 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0372  hypothetical protein  29.5 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0202858  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0354  hypothetical protein  29.5 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000126383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  25.81 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  25.17 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0953  flavin reductase-like, FMN-binding protein  31.54 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  34.23 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  28.21 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.45 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.45 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2602  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.62 
 
 		 160 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  25.15 
 
 		 194 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3504  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.38 
 
 		 160 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.507811  normal  0.0756522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  29.46 
 
 		 164 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.07 
 
 		 190 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  28.03 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.03 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  34.78 
 
 		 189 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  28.57 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  23.67 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  26.97 
 
 		 180 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  28.03 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  24.59 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  25.74 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0917  hypothetical protein  26.95 
 
 		 162 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00504908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1919  flavin reductase-like, FMN-binding  26.15 
 
 		 159 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  28.67 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09761  hypothetical protein  26.67 
 
 		 162 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  29.22 
 
 		 182 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  28.21 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  28.21 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4081  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.03 
 
 		 163 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09781  hypothetical protein  26.67 
 
 		 162 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  28.21 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.61 
 
 		 190 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1337  flavin reductase domain-containing protein  32.76 
 
 		 146 aa  52.4  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 		 311 aa  52.4  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  22.44 
 
 		 185 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  26.42 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.71 
 
 		 165 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2073  hypothetical protein  30.5 
 
 		 168 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00879028  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  26.58 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  25.15 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  31.21 
 
 		 167 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  28.21 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  26.98 
 
 		 189 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  27.94 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  28.26 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08811  hypothetical protein  27.1 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>