59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0354 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0354  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  326  8e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000126383  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0372  hypothetical protein  99.36 
 
 		 157 aa  320  5e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0202858  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1565  hypothetical protein  36.65 
 
 		 170 aa  92.8  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  30.2 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  34 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  34.84 
 
 		 171 aa  83.6  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.21 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2073  hypothetical protein  32.65 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00879028  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1037  hypothetical protein  27.81 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0311  hypothetical protein  30.07 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0535887  decreased coverage  0.000000645484 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0597  hypothetical protein  26.45 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1404  putative flavoredoxin  32 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20750  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.45 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2772  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  28.39 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0039  hypothetical protein  32.19 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  30.22 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2093  hypothetical protein  27.81 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.16533  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  25.87 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0615  hypothetical protein  26.79 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0918214 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.48 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  27.78 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1379  hypothetical protein  24.67 
 
 		 189 aa  50.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.203696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3412  hypothetical protein  23.08 
 
 		 177 aa  50.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.17 
 
 		 186 aa  50.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  31.48 
 
 		 209 aa  50.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  28.28 
 
 		 200 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  26.53 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  30.63 
 
 		 248 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  31.34 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  28.47 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  28.7 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  28.7 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.89 
 
 		 190 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.41 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  28.3 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  27.21 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  27.97 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  27.1 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  27.1 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  28.36 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  28.15 
 
 		 189 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  26.24 
 
 		 216 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  28.67 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.67 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0001  flavin reductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117623  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  27.34 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3170  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.64 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.84 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  25.17 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.81 
 
 		 185 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.27 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.87 
 
 		 194 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0319  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.21 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.42584 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2008  hypothetical protein  26 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  26.45 
 
 		 185 aa  41.6  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  27.97 
 
 		 195 aa  41.2  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  32.26 
 
 		 201 aa  40.8  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>