35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1037 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1037  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  352  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1565  hypothetical protein  42.24 
 
 
170 aa  142  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2545  hypothetical protein  40 
 
 
170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0039  hypothetical protein  40.36 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0597  hypothetical protein  39.13 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2073  hypothetical protein  39.39 
 
 
168 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00879028  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2093  hypothetical protein  44.37 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.16533  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3412  hypothetical protein  36.9 
 
 
177 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  35.17 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  33.79 
 
 
169 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1379  hypothetical protein  33.54 
 
 
189 aa  92  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.203696 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.81 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0615  hypothetical protein  33.99 
 
 
182 aa  85.1  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0918214 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2772  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  33.33 
 
 
160 aa  80.5  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  30.37 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1404  putative flavoredoxin  30 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0354  hypothetical protein  27.81 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000126383  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0372  hypothetical protein  27.81 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0202858  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0311  hypothetical protein  31.06 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0535887  decreased coverage  0.000000645484 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20750  conserved protein of DIM6/NTAB family  25.88 
 
 
186 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  31.78 
 
 
195 aa  56.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  29.25 
 
 
209 aa  48.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  34.83 
 
 
192 aa  47.4  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  28.18 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
189 aa  45.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.48 
 
 
215 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.69 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  24.43 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 
185 aa  42.4  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  25.74 
 
 
189 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  27.74 
 
 
152 aa  41.6  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  27.55 
 
 
189 aa  41.2  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.66 
 
 
189 aa  41.2  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  23.76 
 
 
189 aa  40.8  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  28.71 
 
 
216 aa  40.8  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>