26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2093 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2093  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  371  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.16533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2073  hypothetical protein  46.24 
 
 
168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00879028  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0597  hypothetical protein  41.72 
 
 
168 aa  127  6e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2545  hypothetical protein  42.18 
 
 
170 aa  117  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1037  hypothetical protein  44.37 
 
 
168 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1565  hypothetical protein  38.04 
 
 
170 aa  112  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0039  hypothetical protein  42.48 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  37.91 
 
 
169 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.86 
 
 
168 aa  85.1  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  31.68 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  34.38 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2772  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  31.47 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20750  conserved protein of DIM6/NTAB family  35.19 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0311  hypothetical protein  36.49 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0535887  decreased coverage  0.000000645484 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1404  putative flavoredoxin  30.67 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0615  hypothetical protein  35.45 
 
 
182 aa  70.9  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0918214 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3412  hypothetical protein  31.61 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1379  hypothetical protein  33.94 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.203696 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0372  hypothetical protein  27.81 
 
 
157 aa  57.8  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0202858  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0354  hypothetical protein  27.81 
 
 
159 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000126383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  33.9 
 
 
189 aa  48.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.68 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  27.93 
 
 
209 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.87 
 
 
185 aa  41.6  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  32.26 
 
 
162 aa  42  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  33.06 
 
 
189 aa  41.6  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>