36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0615 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0615  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  377  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0918214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1379  hypothetical protein  65.34 
 
 
189 aa  259  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.203696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3412  hypothetical protein  63.07 
 
 
177 aa  246  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0597  hypothetical protein  31.58 
 
 
168 aa  105  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2073  hypothetical protein  35.53 
 
 
168 aa  94  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00879028  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1565  hypothetical protein  30.72 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1037  hypothetical protein  33.99 
 
 
168 aa  85.1  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2545  hypothetical protein  36.29 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0039  hypothetical protein  41.67 
 
 
174 aa  82  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2093  hypothetical protein  35.45 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.16533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  32.89 
 
 
169 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1404  putative flavoredoxin  28.48 
 
 
178 aa  58.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  29.53 
 
 
168 aa  58.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.61 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0354  hypothetical protein  26.79 
 
 
159 aa  55.1  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000126383  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0372  hypothetical protein  26.79 
 
 
157 aa  55.1  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0202858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.83 
 
 
186 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  32.93 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  25.81 
 
 
171 aa  52  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  27.35 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  29.29 
 
 
209 aa  47.8  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.69 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0311  hypothetical protein  24.82 
 
 
160 aa  45.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0535887  decreased coverage  0.000000645484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.53 
 
 
194 aa  44.3  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  27.68 
 
 
189 aa  44.3  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.21 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  31.07 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  28.16 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 
190 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2772  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  26.06 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  25 
 
 
177 aa  42  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  28.1 
 
 
192 aa  41.6  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  28.1 
 
 
192 aa  41.6  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.11 
 
 
190 aa  41.6  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.86 
 
 
195 aa  41.2  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  24.69 
 
 
200 aa  40.8  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>