96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00640 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  100 
 
 
171 aa  355  1.9999999999999998e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1404  putative flavoredoxin  45.2 
 
 
178 aa  179  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20750  conserved protein of DIM6/NTAB family  46.37 
 
 
186 aa  162  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.48 
 
 
168 aa  148  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  41.67 
 
 
168 aa  147  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  40.24 
 
 
169 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2772  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  35.57 
 
 
160 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0311  hypothetical protein  32.88 
 
 
160 aa  95.5  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0535887  decreased coverage  0.000000645484 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0354  hypothetical protein  34.84 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000126383  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0372  hypothetical protein  35.53 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0202858  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1565  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2093  hypothetical protein  34.38 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.16533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2073  hypothetical protein  34.03 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00879028  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1037  hypothetical protein  30.37 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0597  hypothetical protein  33.11 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  30.2 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0039  hypothetical protein  31.45 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.72 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  36.89 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.14 
 
 
192 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  31.34 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.92 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  39.25 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.89 
 
 
190 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.14 
 
 
194 aa  62.4  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  34.26 
 
 
192 aa  61.6  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  34.26 
 
 
192 aa  61.6  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2545  hypothetical protein  30.6 
 
 
170 aa  61.6  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.25 
 
 
186 aa  61.2  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.86 
 
 
189 aa  60.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.62 
 
 
195 aa  60.8  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  38.54 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  36.7 
 
 
189 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.46 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  37.11 
 
 
191 aa  58.9  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  34.65 
 
 
200 aa  58.9  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  39.6 
 
 
189 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  33.06 
 
 
189 aa  58.2  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  34.95 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3412  hypothetical protein  29.68 
 
 
177 aa  55.1  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  30.93 
 
 
209 aa  54.7  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.02 
 
 
190 aa  54.7  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  26 
 
 
192 aa  53.9  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
195 aa  53.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.03 
 
 
197 aa  52  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.57 
 
 
160 aa  52  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  32.71 
 
 
178 aa  52  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0615  hypothetical protein  25.81 
 
 
182 aa  52  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0918214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1379  hypothetical protein  29.25 
 
 
189 aa  51.6  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.203696 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.46 
 
 
215 aa  50.8  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  33 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.7 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  30.63 
 
 
216 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  25.41 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  30.56 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  30.91 
 
 
177 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.15 
 
 
193 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.63 
 
 
185 aa  48.1  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.85 
 
 
225 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  29 
 
 
186 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  28.85 
 
 
190 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  31.43 
 
 
176 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  32.63 
 
 
189 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.38 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  34.07 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  29.91 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.07 
 
 
189 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  32.97 
 
 
189 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  32.97 
 
 
189 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  25.33 
 
 
208 aa  45.1  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  23.38 
 
 
195 aa  45.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  30.69 
 
 
190 aa  45.1  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  32.97 
 
 
189 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  32.97 
 
 
189 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.41 
 
 
189 aa  44.7  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.48 
 
 
192 aa  44.3  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  25.76 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  27.74 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  28.47 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  29.17 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.97 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.91 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.11 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  45 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  27.1 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  37.31 
 
 
219 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.35 
 
 
203 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  29.91 
 
 
180 aa  41.6  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.17 
 
 
186 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  24.38 
 
 
149 aa  41.6  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.91 
 
 
180 aa  41.2  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  31.48 
 
 
180 aa  40.8  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  24.38 
 
 
149 aa  40.8  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  29.27 
 
 
248 aa  40.8  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  26.25 
 
 
202 aa  40.8  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  26.85 
 
 
187 aa  40.8  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>