103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1404 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1404  putative flavoredoxin  100 
 
 		 178 aa  367  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20750  conserved protein of DIM6/NTAB family  53.63 
 
 		 186 aa  215  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  45.2 
 
 		 171 aa  179  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.45 
 
 		 168 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  41.95 
 
 		 168 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  40.78 
 
 		 169 aa  140  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2772  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  40.12 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0311  hypothetical protein  35.67 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0535887  decreased coverage  0.000000645484 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2073  hypothetical protein  35.15 
 
 		 168 aa  85.1  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00879028  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0597  hypothetical protein  33.12 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1565  hypothetical protein  31.1 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1037  hypothetical protein  30 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2093  hypothetical protein  30.67 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.16533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2545  hypothetical protein  32.69 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.14 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0354  hypothetical protein  32 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000126383  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0372  hypothetical protein  32 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0202858  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  29.41 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  29.41 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  35.19 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.64 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  34.26 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  31.53 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1379  hypothetical protein  30.38 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.203696 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  32.77 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  37.11 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.24 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.61 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.56 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  33.05 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.01 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.71 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  31.15 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0615  hypothetical protein  28.48 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0918214 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.94 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0039  hypothetical protein  29.94 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  24.24 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  34.48 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  26.17 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  30.28 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  37.04 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.17 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  37.04 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  35.19 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  26.17 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3412  hypothetical protein  28.46 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.84 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  31.13 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.43 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  29.73 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.04 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.63 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  32.11 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  24.57 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.11 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.97 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.11 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.43 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  29.46 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  33.03 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  31.97 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  33.01 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  30.28 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  25.95 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  29.63 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  26.32 
 
 		 208 aa  51.6  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  24.22 
 
 		 194 aa  51.2  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  33.65 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  30 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  33.03 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.04 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  27.52 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.05 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 149 aa  48.5  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 149 aa  48.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.41 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  30.84 
 
 		 180 aa  47.8  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.39 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  33.66 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  33.66 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  32.04 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.7 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  23.73 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.46 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  23.57 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  28.97 
 
 		 185 aa  44.3  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  29.63 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  24.59 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  24.77 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  24.56 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.22 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.63 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.07 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  25.44 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  24.56 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  27.03 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>