126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0249 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  100 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  45.95 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  38.62 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.08 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  35.98 
 
 		 189 aa  121  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.84 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.32 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  35.79 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.26 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.8 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  35.98 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.66 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.87 
 
 		 190 aa  111  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  32.22 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  32.26 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  32.26 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  35.08 
 
 		 189 aa  104  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  31.05 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  33.15 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.18 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  29.67 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.42 
 
 		 195 aa  92.8  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.11 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.58 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  31.52 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  28.04 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  26.97 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  28.04 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  26.11 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.58 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  27.61 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  29.48 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  29.69 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  28.32 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.43 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  23.89 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.01 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  26.71 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  26.71 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33014  predicted protein  27.04 
 
 		 436 aa  53.9  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111303  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  27.22 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.42 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.78 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.52 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  24.38 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  23.6 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  29.69 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  25.18 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.61 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  25.49 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.8 
 
 		 233 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  29.05 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1051  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24.47 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.136443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  25.66 
 
 		 210 aa  48.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1050  hypothetical protein  26.62 
 
 		 191 aa  48.1  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.27 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  27.27 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  27.27 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  31.62 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  28.67 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  26.51 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  23.27 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  25.3 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  25.93 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  25 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  27.35 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  27.14 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.73 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  23.08 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.79 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.38 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  28.06 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  26.49 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2559  hypothetical protein  18.13 
 
 		 183 aa  45.1  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  25.89 
 
 		 165 aa  44.7  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.58 
 
 		 223 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  26.24 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  24.07 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  25.66 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  28.08 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  26.17 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  25 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  27.52 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  22.78 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.18 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.08 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  23.97 
 
 		 248 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  28.09 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  24.11 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  28.09 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  28.35 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  22.35 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0091  hypothetical protein  27.08 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121116 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>