67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0091 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0091  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  62.38 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2891  hypothetical protein  55.92 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0926  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.77 
 
 		 228 aa  248  6e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  normal  0.0485806 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3365  hypothetical protein  54.5 
 
 		 244 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4803  hypothetical protein  54.5 
 
 		 244 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3299  hypothetical protein  53.3 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4151  hypothetical protein  54.03 
 
 		 234 aa  241  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.807728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5225  hypothetical protein  54.76 
 
 		 242 aa  238  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.408717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  51.63 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  50 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5960  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.59 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4625  hypothetical protein  41.46 
 
 		 215 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1051  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.35 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.136443 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1414  hypothetical protein  36.51 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.73 
 
 		 209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1997  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.43 
 
 		 185 aa  118  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.418492  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0925  hypothetical protein  31.5 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339303  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.22 
 
 		 196 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1355  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.73 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2620  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.74 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.592321  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  27.01 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  26.47 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  27.78 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  27.78 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.1 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.91 
 
 		 123 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  29.7 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  28.57 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  28.93 
 
 		 205 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2920  hypothetical protein  24.88 
 
 		 202 aa  52  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.5 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.04 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  28.3 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  29.63 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.45 
 
 		 186 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  28.21 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  27.16 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  25.13 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.27 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  25 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  27.22 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  30.3 
 
 		 209 aa  45.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  27.22 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0076  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  25 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208777  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  28.04 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  25.93 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  28.11 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  25.25 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  28.85 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  25.31 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  27.67 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.18 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  27.16 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  27.32 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  28.66 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.26 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  22.3 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  28.48 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  27.08 
 
 		 187 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  23.56 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  24 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  27.61 
 
 		 207 aa  42  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1531  hypothetical protein  27.96 
 
 		 162 aa  41.6  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  29.84 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  29.84 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>