49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1414 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1414  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  464  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563385  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4625  hypothetical protein  46.57 
 
 
215 aa  179  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5960  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.69 
 
 
237 aa  165  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5225  hypothetical protein  43.05 
 
 
242 aa  164  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.408717  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3299  hypothetical protein  43.32 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1051  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  46 
 
 
216 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.136443 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2891  hypothetical protein  42.18 
 
 
244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4151  hypothetical protein  42.18 
 
 
234 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.807728  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  41.24 
 
 
236 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4803  hypothetical protein  41.23 
 
 
244 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3365  hypothetical protein  41.23 
 
 
244 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947046  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.7 
 
 
233 aa  148  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1997  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.47 
 
 
185 aa  141  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.418492  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0925  hypothetical protein  34.67 
 
 
198 aa  139  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0926  flavin reductase domain protein FMN-binding  36 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  normal  0.0485806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0091  hypothetical protein  36.51 
 
 
233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  36.98 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.17 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2620  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.83 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.592321  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.16 
 
 
196 aa  118  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1355  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.29 
 
 
196 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  29.41 
 
 
221 aa  58.5  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  26.8 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  28.14 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  25.16 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.05 
 
 
295 aa  48.5  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  26.54 
 
 
196 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  31.2 
 
 
177 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  29.2 
 
 
178 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  25.95 
 
 
205 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  23.56 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.07 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  30.71 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.13 
 
 
194 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.11 
 
 
294 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  31.91 
 
 
201 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  29.23 
 
 
176 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.37 
 
 
180 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  24.73 
 
 
203 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.12 
 
 
180 aa  42.4  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  26.32 
 
 
213 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  25.37 
 
 
202 aa  42.4  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.1 
 
 
190 aa  42  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  25.74 
 
 
180 aa  42  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.62 
 
 
195 aa  42  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  24.12 
 
 
195 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.1 
 
 
190 aa  42  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.77 
 
 
219 aa  41.6  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  28.24 
 
 
177 aa  41.6  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>