125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0926 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0926  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
228 aa  476  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  normal  0.0485806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  59.63 
 
 
236 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3299  hypothetical protein  57.8 
 
 
233 aa  258  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4803  hypothetical protein  58.26 
 
 
244 aa  256  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3365  hypothetical protein  58.26 
 
 
244 aa  256  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947046  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2891  hypothetical protein  57.8 
 
 
244 aa  255  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4151  hypothetical protein  57.8 
 
 
234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.807728  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0091  hypothetical protein  53.77 
 
 
233 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5225  hypothetical protein  55.05 
 
 
242 aa  245  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.408717  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  49.76 
 
 
226 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.53 
 
 
233 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4625  hypothetical protein  41.46 
 
 
215 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1051  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.44 
 
 
216 aa  145  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.136443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5960  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.74 
 
 
237 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1414  hypothetical protein  36 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563385  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1997  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.9 
 
 
185 aa  129  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.418492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.96 
 
 
196 aa  115  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1355  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.96 
 
 
196 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.78 
 
 
209 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0925  hypothetical protein  29.9 
 
 
198 aa  102  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339303  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2620  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.18 
 
 
196 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.592321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.12 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  30.38 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  31.65 
 
 
205 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.12 
 
 
190 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  23.91 
 
 
209 aa  58.5  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  25.85 
 
 
188 aa  56.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  23.65 
 
 
191 aa  54.7  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  26.27 
 
 
188 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.3 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  29.75 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  29.75 
 
 
205 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.36 
 
 
180 aa  52  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  30.95 
 
 
207 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  27.69 
 
 
189 aa  51.6  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  29.11 
 
 
208 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  22.71 
 
 
192 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  22.71 
 
 
192 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  28.4 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  30.36 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  29.11 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2920  hypothetical protein  25.52 
 
 
202 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1499  FMN-binding protein  26.97 
 
 
202 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.23332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  24.52 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  28.23 
 
 
180 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  24.86 
 
 
204 aa  49.3  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  27.04 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  28.26 
 
 
209 aa  49.3  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  29.63 
 
 
205 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  27.16 
 
 
206 aa  49.3  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.7 
 
 
190 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  27.16 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  26.98 
 
 
203 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  26.58 
 
 
221 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.23 
 
 
180 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  27.51 
 
 
200 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  26.37 
 
 
221 aa  48.5  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  24 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.11 
 
 
295 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  26.58 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  26.54 
 
 
209 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.61 
 
 
180 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  26.38 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  27.67 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  27.67 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  26.88 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  27.67 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.67 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  26.26 
 
 
189 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  27.56 
 
 
209 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  27.67 
 
 
209 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  25 
 
 
190 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.78 
 
 
192 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.67 
 
 
189 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  26.25 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.74 
 
 
195 aa  45.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  27.15 
 
 
194 aa  45.8  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  31.18 
 
 
188 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  27.67 
 
 
209 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  25.95 
 
 
208 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.33 
 
 
186 aa  45.4  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.04 
 
 
190 aa  45.4  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  25.95 
 
 
208 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.37 
 
 
186 aa  45.1  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  25.95 
 
 
208 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  30.22 
 
 
177 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  25.93 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  30.4 
 
 
177 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  29.75 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  26.25 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  31.54 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  26.54 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  29.75 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  28.23 
 
 
185 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  32.73 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  28.46 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  28.66 
 
 
184 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.14 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.53 
 
 
189 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  26.25 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>