50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4625 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4625  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  435  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5960  flavin reductase domain protein FMN-binding  62.81 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1051  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  65.5 
 
 		 216 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.136443 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1414  hypothetical protein  46.57 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  47.64 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  47.34 
 
 		 236 aa  168  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3299  hypothetical protein  45.32 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1997  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.54 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.418492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.86 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5225  hypothetical protein  45.32 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.408717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4151  hypothetical protein  42.86 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.807728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0926  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.46 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  normal  0.0485806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0091  hypothetical protein  41.46 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2891  hypothetical protein  41.98 
 
 		 244 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3365  hypothetical protein  41.87 
 
 		 244 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4803  hypothetical protein  41.87 
 
 		 244 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0925  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339303  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.27 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1355  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.76 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.22 
 
 		 196 aa  126  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2620  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.69 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.592321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.03 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  30.3 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  30.1 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.19 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  23.56 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  30 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0511  hypothetical protein  21.85 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140824  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  28.4 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  27.5 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  29.03 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.61 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  23.59 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  23.59 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  27.5 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  22.22 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.6 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.25 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  28.03 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  27.06 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  23.16 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  27.39 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  25.65 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  27.22 
 
 		 208 aa  42  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  24.31 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  29.11 
 
 		 208 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.74 
 
 		 209 aa  41.6  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  28.49 
 
 		 216 aa  41.6  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>