34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5960 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5960  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 		 237 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4625  hypothetical protein  62.81 
 
 		 215 aa  258  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1051  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  61.93 
 
 		 216 aa  237  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.136443 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1414  hypothetical protein  43.69 
 
 		 225 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5225  hypothetical protein  45.32 
 
 		 242 aa  164  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.408717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  45.03 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0091  hypothetical protein  41.59 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2891  hypothetical protein  43.26 
 
 		 244 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4803  hypothetical protein  42.13 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3365  hypothetical protein  42.13 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4151  hypothetical protein  43.35 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.807728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.92 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  43.06 
 
 		 236 aa  158  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3299  hypothetical protein  43.84 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1997  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.66 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.418492  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0926  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.74 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  normal  0.0485806 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0925  hypothetical protein  34.52 
 
 		 198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339303  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.36 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1355  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.18 
 
 		 196 aa  115  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.69 
 
 		 196 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2620  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.46 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.592321  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0511  hypothetical protein  25.29 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140824  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  31.18 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.81 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  28.02 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0076  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  23.19 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208777  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  26.34 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.27 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  29.67 
 
 		 195 aa  45.8  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  21.8 
 
 		 209 aa  45.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  29.68 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  30.77 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.4 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.91 
 
 		 186 aa  42.4  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>