80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3299 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3299  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  477  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2891  hypothetical protein  87.55 
 
 		 244 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4803  hypothetical protein  85.84 
 
 		 244 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3365  hypothetical protein  85.84 
 
 		 244 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4151  hypothetical protein  84.98 
 
 		 234 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.807728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5225  hypothetical protein  80.95 
 
 		 242 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.408717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  63.8 
 
 		 236 aa  291  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0926  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.8 
 
 		 228 aa  258  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  normal  0.0485806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0091  hypothetical protein  53.3 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  52.94 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.75 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1414  hypothetical protein  43.32 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4625  hypothetical protein  45.32 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5960  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.84 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1051  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.66 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.136443 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1997  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.63 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.418492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2620  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.01 
 
 		 196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.592321  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0925  hypothetical protein  32.11 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1355  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.52 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.62 
 
 		 196 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.52 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  31.29 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  31.29 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  29.76 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.6 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  32.53 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  31.93 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  32.1 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  31.93 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.74 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  31.28 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  31.93 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  27.78 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  29.81 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  31.07 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  29.48 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  29.59 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  30.3 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  28.4 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  30.73 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  27.5 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0224  FMN-binding protein  29.6 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114733  normal  0.756324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.48 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.56 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.49 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  27.13 
 
 		 196 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 		 186 aa  46.6  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.25 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.504075 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00876  conserved hypothetical protein  32.58 
 
 		 313 aa  45.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.799702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.18 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  31.52 
 
 		 209 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  31.67 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  25.3 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  25.3 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  24.87 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  28.29 
 
 		 185 aa  45.4  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  25 
 
 		 218 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  25.95 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  29.52 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.07 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  24.39 
 
 		 287 aa  44.3  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  31.71 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  28.66 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  28.57 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  25.53 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  30.38 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  26.04 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  26.04 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.56 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  27.67 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  26.58 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.41 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0076  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  21.88 
 
 		 160 aa  42.7  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208777  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  26.42 
 
 		 209 aa  42  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.56 
 
 		 294 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 210 aa  42  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  25.41 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  24.1 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>