115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1051 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1051  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  100 
 
 
216 aa  438  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.136443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4625  hypothetical protein  65.5 
 
 
215 aa  269  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5960  flavin reductase domain protein FMN-binding  61.62 
 
 
237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  49.48 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1414  hypothetical protein  46 
 
 
225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563385  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  50.26 
 
 
236 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.56 
 
 
233 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5225  hypothetical protein  46.77 
 
 
242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.408717  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2891  hypothetical protein  44.5 
 
 
244 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4151  hypothetical protein  45.15 
 
 
234 aa  161  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.807728  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3299  hypothetical protein  44.66 
 
 
233 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1997  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.08 
 
 
185 aa  159  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.418492  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0926  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.44 
 
 
228 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  normal  0.0485806 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4803  hypothetical protein  44.66 
 
 
244 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3365  hypothetical protein  44.66 
 
 
244 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947046  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0091  hypothetical protein  41.35 
 
 
233 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121116 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1355  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.5 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.01 
 
 
209 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0925  hypothetical protein  31.35 
 
 
198 aa  129  5.0000000000000004e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339303  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2620  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.05 
 
 
196 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.592321  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  39.49 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.26 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  35.62 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.18 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  35.44 
 
 
205 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  25.24 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  32.48 
 
 
209 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.55 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  30.53 
 
 
189 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  31.82 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  31.95 
 
 
203 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.64 
 
 
190 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  26.4 
 
 
191 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  29.38 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  25.13 
 
 
188 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
195 aa  55.5  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.15 
 
 
195 aa  55.1  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  30 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  29.95 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  28.5 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  28.4 
 
 
205 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  26.63 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  24.34 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  32.98 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  27.19 
 
 
200 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  29.47 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  25.54 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.62 
 
 
190 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.67 
 
 
189 aa  51.6  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0076  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  23.26 
 
 
160 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208777  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  29.03 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  28 
 
 
287 aa  51.2  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.66 
 
 
189 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  24.73 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  29.45 
 
 
205 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  30.97 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.3 
 
 
294 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  29.03 
 
 
208 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  27.62 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  29.68 
 
 
176 aa  48.9  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  26.74 
 
 
219 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  28.99 
 
 
203 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.68 
 
 
209 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  28.98 
 
 
201 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.98 
 
 
201 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  28.41 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.07 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  30.13 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  25.13 
 
 
188 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  27.61 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  28.4 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  26.23 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  28.41 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  29.3 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.15 
 
 
294 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0511  hypothetical protein  22.22 
 
 
253 aa  45.4  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140824  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  32.26 
 
 
184 aa  45.4  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  27.92 
 
 
230 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  27.92 
 
 
230 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.39 
 
 
176 aa  45.4  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  24.86 
 
 
292 aa  45.1  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 
209 aa  45.1  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  27.95 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  28.3 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  30.77 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1050  hypothetical protein  25.48 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.2 
 
 
192 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  25.95 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  33.11 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0361  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.32 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.26 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.21 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.83 
 
 
186 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.09 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  23.5 
 
 
190 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  29.81 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.87 
 
 
180 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>