89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1355 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1355  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 		 196 aa  397  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  93.37 
 
 		 196 aa  374  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  81.63 
 
 		 209 aa  344  5e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2620  flavin reductase domain protein FMN-binding  60 
 
 		 196 aa  256  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.592321  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0925  hypothetical protein  33.85 
 
 		 198 aa  148  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339303  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1997  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.25 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.418492  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4625  hypothetical protein  34.76 
 
 		 215 aa  127  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1051  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.5 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.136443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5960  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.18 
 
 		 237 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3365  hypothetical protein  35.16 
 
 		 244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4803  hypothetical protein  35.16 
 
 		 244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0926  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.96 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  normal  0.0485806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  33.84 
 
 		 236 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0091  hypothetical protein  30.73 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4151  hypothetical protein  34.07 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.807728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2891  hypothetical protein  34.07 
 
 		 244 aa  110  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3299  hypothetical protein  33.52 
 
 		 233 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5225  hypothetical protein  32.97 
 
 		 242 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.408717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1414  hypothetical protein  29.29 
 
 		 225 aa  107  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.25 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  31.11 
 
 		 226 aa  99  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0511  hypothetical protein  24.43 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  24.62 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.29 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1050  hypothetical protein  28.31 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  26.42 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  24 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  24.24 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  23.68 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.5 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.5 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  24.5 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.87 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.63 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  25.27 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.62 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  23.42 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  23.78 
 
 		 178 aa  52.4  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  28.77 
 
 		 180 aa  51.6  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  27.96 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  22.8 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  24.5 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  24.12 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  22.84 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.95 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  24.38 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.35 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  27.41 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  22 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1499  FMN-binding protein  23.28 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.23332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  23.5 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.61 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.42 
 
 		 176 aa  48.5  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  29.11 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  22.6 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  21.5 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  22 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  27.61 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.11 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.85 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.69 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.6 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  24.82 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.43 
 
 		 295 aa  45.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0361  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  21.25 
 
 		 178 aa  45.1  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  24.83 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  20.88 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  29.75 
 
 		 292 aa  43.5  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.08 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  23.08 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.11 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  23.24 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  23.94 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.11 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  25 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  25 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  23.74 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.35 
 
 		 185 aa  42  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  22.67 
 
 		 201 aa  42  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  23.36 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0076  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  22.86 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  21.97 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  21.91 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  21.95 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>