86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1997 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1997  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 		 185 aa  383  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.418492  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4625  hypothetical protein  40.54 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5960  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.66 
 
 		 237 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1051  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.08 
 
 		 216 aa  151  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.136443 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.44 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.8 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1355  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.25 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2620  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.36 
 
 		 196 aa  141  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.592321  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1414  hypothetical protein  39.47 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2891  hypothetical protein  38.62 
 
 		 244 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  39.25 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0925  hypothetical protein  34.43 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339303  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5225  hypothetical protein  38.1 
 
 		 242 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.408717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.67 
 
 		 233 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3299  hypothetical protein  37.63 
 
 		 233 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4151  hypothetical protein  37.84 
 
 		 234 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.807728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4803  hypothetical protein  37.04 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3365  hypothetical protein  37.04 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0926  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.9 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  normal  0.0485806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  35.36 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0091  hypothetical protein  32.43 
 
 		 233 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.14 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.7 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.68 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.37 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.66 
 
 		 295 aa  61.6  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  24.04 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  24.44 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.95 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  26.42 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  26.25 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  23.33 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.44 
 
 		 294 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  23.89 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  26.22 
 
 		 292 aa  51.6  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  26.25 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.83 
 
 		 196 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  23.37 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.84 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  26.46 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  23.12 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  27.33 
 
 		 221 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  23.9 
 
 		 201 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  25.79 
 
 		 201 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  26.71 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  26 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  26.09 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  26.71 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  26.71 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  25.5 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  23.9 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  29.63 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  22.78 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  25 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.35 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.36 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  25.75 
 
 		 207 aa  45.1  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  26.38 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  29.41 
 
 		 186 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  29.2 
 
 		 209 aa  44.7  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  22.93 
 
 		 207 aa  44.7  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  23.66 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0076  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  22.73 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208777  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.32 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  27.96 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  25.32 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  21.31 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.81 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  20.32 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.15 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.53 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.45 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  24.85 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.05 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  26.32 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  24.05 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  25.18 
 
 		 177 aa  42  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.85 
 
 		 186 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  26.11 
 
 		 206 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  24.18 
 
 		 213 aa  41.6  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  26.37 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  24.83 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  24.05 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0224  FMN-binding protein  22.42 
 
 		 203 aa  41.2  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114733  normal  0.756324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  25.81 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>