88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4151 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4151  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.807728  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4803  hypothetical protein  94.85 
 
 
244 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3365  hypothetical protein  94.85 
 
 
244 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947046  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2891  hypothetical protein  90.99 
 
 
244 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3299  hypothetical protein  84.98 
 
 
233 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5225  hypothetical protein  81.78 
 
 
242 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.408717  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  62.72 
 
 
236 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0926  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.8 
 
 
228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  normal  0.0485806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0091  hypothetical protein  54.03 
 
 
233 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  52.45 
 
 
226 aa  198  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.75 
 
 
233 aa  195  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5960  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.35 
 
 
237 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4625  hypothetical protein  42.86 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1414  hypothetical protein  42.18 
 
 
225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563385  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1051  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  45.15 
 
 
216 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.136443 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1997  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.84 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.418492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2620  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.81 
 
 
196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.592321  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1355  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.07 
 
 
196 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.16 
 
 
196 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0925  hypothetical protein  30.53 
 
 
198 aa  112  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339303  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.52 
 
 
209 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  31.9 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.28 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  27.27 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  29.94 
 
 
196 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  32.5 
 
 
207 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.94 
 
 
196 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  35.29 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.16 
 
 
295 aa  52  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0224  FMN-binding protein  31.2 
 
 
203 aa  52  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114733  normal  0.756324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  33.61 
 
 
208 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  31.52 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  28.11 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  32.31 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  32.79 
 
 
208 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.25 
 
 
189 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  30 
 
 
221 aa  48.9  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  32.5 
 
 
214 aa  48.9  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  29.09 
 
 
208 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.08 
 
 
195 aa  48.9  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  29.09 
 
 
208 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  29.09 
 
 
208 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  28.75 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  31.06 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  30.64 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  25 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.59 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  34.71 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.84 
 
 
186 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.52 
 
 
186 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  30.56 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  30 
 
 
177 aa  45.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  30.82 
 
 
185 aa  45.8  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  32.26 
 
 
207 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  31.25 
 
 
140 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  30.25 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  31.01 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  29.01 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.92 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.18 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0076  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  23.48 
 
 
160 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208777  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  30.25 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.42 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  29.52 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  28.65 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  25.6 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  25.6 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  31.09 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.72 
 
 
123 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  31.93 
 
 
205 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  28.89 
 
 
186 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  24.84 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  26.63 
 
 
189 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  25.6 
 
 
229 aa  42.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0361  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.23 
 
 
200 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  28.57 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  28.57 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  28.57 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  29.03 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  26.36 
 
 
186 aa  42  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.33 
 
 
209 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  27.22 
 
 
202 aa  42.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  20.65 
 
 
185 aa  42.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.82 
 
 
195 aa  42.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  28.23 
 
 
188 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00876  conserved hypothetical protein  30.3 
 
 
313 aa  42  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.799702  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  29.44 
 
 
188 aa  41.6  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.56 
 
 
294 aa  41.6  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>