274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1572 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  71.43 
 
 		 190 aa  292  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  72.49 
 
 		 190 aa  287  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  60.64 
 
 		 188 aa  245  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  56.91 
 
 		 189 aa  240  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  60.22 
 
 		 188 aa  240  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  60 
 
 		 190 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  57.45 
 
 		 189 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  58.51 
 
 		 191 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.67 
 
 		 189 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  56.61 
 
 		 200 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.26 
 
 		 194 aa  229  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.45 
 
 		 192 aa  230  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  56.38 
 
 		 189 aa  228  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  53.72 
 
 		 189 aa  223  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.84 
 
 		 190 aa  222  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.76 
 
 		 190 aa  218  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.38 
 
 		 189 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.09 
 
 		 195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  43.55 
 
 		 189 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  39.79 
 
 		 216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.3 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  34.5 
 
 		 209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 		 195 aa  124  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  36.47 
 
 		 200 aa  121  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  35.48 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  34.44 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  36.51 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  37.23 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  35.26 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.14 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  29.89 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  34.44 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  37.14 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  33.16 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.53 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.94 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  30.11 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  30.11 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.41 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.39 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.73 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.91 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.82 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  34.56 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  30.83 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2037  hypothetical protein  27.38 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.902665  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  30.25 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2559  hypothetical protein  25.15 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  29.03 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  28.12 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  27.15 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  31.06 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.06 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  36.52 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  29.63 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.03 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  36.04 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  25.76 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  36.04 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.94 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  27.41 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  36.04 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.56 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  36.04 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  36.04 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  36.04 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.77 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  31.4 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  27.22 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  28.99 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.34 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  26.67 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.79 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  31.93 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  25.56 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.86 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.66 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  29.66 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  31.71 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  29.77 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  26.32 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.39 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  27.46 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  24.56 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  29.75 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.68 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.44 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  32.12 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  31.1 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  28.03 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  23.7 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  26.28 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  23.67 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  23.33 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.6 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  29.6 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  27.49 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.19 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.27 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>