249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2549 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 190 aa  394  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  71.43 
 
 		 190 aa  292  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  61.58 
 
 		 190 aa  259  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  57.98 
 
 		 189 aa  238  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  57.98 
 
 		 188 aa  235  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  56.91 
 
 		 189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  56.99 
 
 		 188 aa  228  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  55.85 
 
 		 189 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.5 
 
 		 190 aa  226  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  54.3 
 
 		 200 aa  220  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.79 
 
 		 192 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.63 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.03 
 
 		 189 aa  218  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.16 
 
 		 190 aa  218  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.19 
 
 		 194 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  51.06 
 
 		 191 aa  214  9e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  48.94 
 
 		 189 aa  203  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.03 
 
 		 189 aa  201  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  45.5 
 
 		 189 aa  197  7e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.56 
 
 		 195 aa  185  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  36.7 
 
 		 216 aa  146  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.52 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  37.34 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.36 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  32.6 
 
 		 209 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  36.61 
 
 		 186 aa  118  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  34.76 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  34.76 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  30.81 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.22 
 
 		 186 aa  111  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  31.49 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.61 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  31.05 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  35.43 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  29.44 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.28 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  30.38 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  30.38 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.29 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  32.58 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.64 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.05 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  31.88 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.56 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.01 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  26.47 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  28.24 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  27.41 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2037  hypothetical protein  29.33 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.902665  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  27.91 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.15 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  29.66 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  28.24 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  31.29 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  28.89 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  29.69 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.39 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  26.95 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  27.17 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  29.55 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1056  hypothetical protein  27.16 
 
 		 217 aa  62  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  30.67 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06661  hypothetical protein  28.75 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  30.18 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  25.58 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  29.37 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  32.69 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  23.84 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2559  hypothetical protein  23.2 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.74 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  26.95 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.2 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.32 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  27.27 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  27.88 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  26.81 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.6 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.41 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.04 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  28.11 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.82 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  30.91 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  30.91 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  26.44 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  30.91 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  32.77 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1948  hypothetical protein  27.78 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00544645  normal  0.0118846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  30.91 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  27.33 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.03 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  26.85 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  30.91 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  25.9 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.78 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  24.86 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03932  hypothetical protein  26.88 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  24.58 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>