130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1948 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1948  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  441  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00544645  normal  0.0118846 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0518  hypothetical protein  76.97 
 
 
152 aa  243  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39511  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3930  hypothetical protein  54.85 
 
 
219 aa  238  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2037  hypothetical protein  56.02 
 
 
202 aa  222  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.902665  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06661  hypothetical protein  51.23 
 
 
229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1056  hypothetical protein  49.25 
 
 
217 aa  206  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03932  hypothetical protein  47.15 
 
 
209 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07816  hypothetical protein  38.69 
 
 
211 aa  159  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  25.52 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.57 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  27.65 
 
 
189 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  27.37 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  26.44 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.37 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  27.06 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  26.7 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  28.03 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  24.74 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  27.06 
 
 
201 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  26.47 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  26.82 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  26.79 
 
 
203 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  24.71 
 
 
209 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.39 
 
 
190 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  24.21 
 
 
209 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  24.21 
 
 
209 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  24.21 
 
 
209 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.34 
 
 
190 aa  62  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.47 
 
 
209 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  22.47 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  22.47 
 
 
208 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.9 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  30.06 
 
 
292 aa  59.3  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  21.91 
 
 
208 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 
203 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  22.47 
 
 
210 aa  58.2  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  24.55 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  21.91 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.41 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  24.14 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  27.65 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  25.14 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  25.48 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  23.16 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  27.68 
 
 
291 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.7 
 
 
295 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  21.51 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  23.16 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  27.78 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  23.4 
 
 
207 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  22.63 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  24.57 
 
 
208 aa  56.2  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  23.56 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  23.56 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  22.63 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  27.04 
 
 
205 aa  55.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  22.34 
 
 
209 aa  55.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  25.29 
 
 
209 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  26.51 
 
 
201 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  27.61 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  28.12 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  25.77 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  24.55 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  22.93 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  23.4 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  25.75 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  23.03 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  24.58 
 
 
201 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.8 
 
 
203 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  23.57 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0224  FMN-binding protein  25.62 
 
 
203 aa  52.8  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114733  normal  0.756324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  24.71 
 
 
201 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  27.54 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  27.92 
 
 
189 aa  52  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.99 
 
 
209 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  24.16 
 
 
203 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  29.45 
 
 
203 aa  52  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  25.56 
 
 
212 aa  52  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  27.54 
 
 
203 aa  52  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  23.56 
 
 
241 aa  51.6  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.61 
 
 
190 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  24.12 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  22.73 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  27.7 
 
 
191 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  24.12 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  23.31 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  24.32 
 
 
200 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  21.23 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  30.15 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  25.93 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  21.05 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  22.7 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  24.59 
 
 
184 aa  49.3  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0420  hypothetical protein  26.25 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0595779  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1499  FMN-binding protein  27.95 
 
 
202 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.23332  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  20.67 
 
 
194 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  24.72 
 
 
203 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  25.58 
 
 
221 aa  48.9  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  24.72 
 
 
203 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  24.84 
 
 
203 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>