164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06661 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06661  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  472  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1948  hypothetical protein  51.23 
 
 		 215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00544645  normal  0.0118846 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3930  hypothetical protein  51.66 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2037  hypothetical protein  52.74 
 
 		 202 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.902665  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1056  hypothetical protein  50.24 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03932  hypothetical protein  50.75 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07816  hypothetical protein  38.35 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0518  hypothetical protein  48.59 
 
 		 152 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  31.25 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  26.7 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.34 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  29.12 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.34 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  28.57 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  28.57 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  27.47 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.67 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  28.73 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  27.47 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  29.11 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  27.47 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  31.61 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  22.66 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  26.56 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  27.47 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  26.6 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  28.48 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  26.56 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.92 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  26.92 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  27.47 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  25.29 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  28.12 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.74 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  27.08 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  27.85 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  26.04 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  29.09 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  27.5 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.56 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.98 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  27.85 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  26.82 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  29.8 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.85 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.57 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  26.37 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  28.9 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  28.9 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  27.22 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  26.95 
 
 		 195 aa  62  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  26.86 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  28.75 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  27.22 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  28.98 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.32 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  25.67 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  29.93 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  31.85 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  29.56 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  27.81 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.07 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  28.3 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  24.48 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  27.61 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  25.32 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  27.85 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  27.81 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  24.31 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  26.01 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  24.57 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  29.53 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  28.4 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  29.91 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  27.56 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.74 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  28.22 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  26.35 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  29.25 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  24.26 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  29.91 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  29.91 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  29.91 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  29.91 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  29.91 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  27.23 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  25.14 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  25.14 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.97 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.29 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  29.91 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.75 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  27.91 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  26.75 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  27.81 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  26.59 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  25.68 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  29.91 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  25.16 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>