35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0518 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0518  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  316  7e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39511  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1948  hypothetical protein  76.97 
 
 		 215 aa  243  8e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00544645  normal  0.0118846 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3930  hypothetical protein  54.3 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2037  hypothetical protein  50.36 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.902665  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1056  hypothetical protein  44.97 
 
 		 217 aa  142  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06661  hypothetical protein  48.59 
 
 		 229 aa  140  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03932  hypothetical protein  41.43 
 
 		 209 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07816  hypothetical protein  34.01 
 
 		 211 aa  95.5  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.14 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.34 
 
 		 295 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  23.81 
 
 		 203 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.96 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.95 
 
 		 203 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  26.62 
 
 		 291 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  19.58 
 
 		 207 aa  45.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  26.56 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  26.19 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  25.81 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  23.19 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  21.83 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  26.83 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.67 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  23.77 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  20.83 
 
 		 212 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  24.6 
 
 		 218 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  25.17 
 
 		 210 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  24.48 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  24.48 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  24.48 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  23.78 
 
 		 208 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  22.22 
 
 		 209 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  23.14 
 
 		 203 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  23.73 
 
 		 190 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.41 
 
 		 209 aa  40.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>