166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07816 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07816  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  436  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1056  hypothetical protein  39.9 
 
 
217 aa  181  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2037  hypothetical protein  41.5 
 
 
202 aa  180  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.902665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3930  hypothetical protein  36.59 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06661  hypothetical protein  38.35 
 
 
229 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1948  hypothetical protein  38.69 
 
 
215 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00544645  normal  0.0118846 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03932  hypothetical protein  36.63 
 
 
209 aa  155  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0518  hypothetical protein  34.01 
 
 
152 aa  95.5  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39511  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  31.13 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  25.14 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.2 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0361  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.97 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  25.13 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  28.5 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  25.14 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  28.25 
 
 
291 aa  62.4  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  27.17 
 
 
200 aa  62  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  25.29 
 
 
230 aa  62  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.08 
 
 
186 aa  61.6  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5124  flavin reductase-like, FMN-binding  23.6 
 
 
216 aa  61.6  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.178532 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1050  hypothetical protein  26.49 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  27.03 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  24.14 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  22.54 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  22.86 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  24.61 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  25 
 
 
241 aa  58.9  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  25 
 
 
207 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  26.71 
 
 
203 aa  58.5  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  24.53 
 
 
213 aa  58.5  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  29.05 
 
 
202 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.12 
 
 
219 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  26.04 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  24.42 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  24.16 
 
 
216 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  22.46 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  27.12 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  27.12 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  23.56 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  23.57 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  22.67 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  22.22 
 
 
229 aa  55.8  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  22.54 
 
 
216 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  26.51 
 
 
214 aa  55.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  18.44 
 
 
209 aa  55.5  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.58 
 
 
185 aa  55.1  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  21.39 
 
 
201 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  24 
 
 
189 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  26.28 
 
 
208 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  22.46 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.3 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  21.14 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  22.11 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  22.63 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  22.22 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  22.22 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  20.81 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.23 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  24.86 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  19.41 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  23.72 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  22.41 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  25.15 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  21.05 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0224  FMN-binding protein  26.75 
 
 
203 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114733  normal  0.756324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  21.38 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  23.16 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  23.29 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  22.11 
 
 
208 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  23.16 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  22.16 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  23.16 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.16 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  24.28 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.11 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  22.54 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  20.11 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02124  hypothetical protein  31.06 
 
 
169 aa  52  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  24.24 
 
 
203 aa  52  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.38 
 
 
196 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  26.27 
 
 
184 aa  51.6  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  23.68 
 
 
209 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  23.16 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  20.12 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  19.5 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  23.16 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  23.16 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  21.58 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  23.16 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  24.16 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  25.42 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  21.05 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  25.61 
 
 
292 aa  50.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  22.47 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  23.94 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  23.71 
 
 
196 aa  49.7  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  24.12 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  21.16 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.82 
 
 
294 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  22.47 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>