141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3930 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3930  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  453  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1948  hypothetical protein  54.85 
 
 		 215 aa  238  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00544645  normal  0.0118846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2037  hypothetical protein  57.5 
 
 		 202 aa  238  8e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.902665  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06661  hypothetical protein  51.66 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03932  hypothetical protein  52.38 
 
 		 209 aa  208  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1056  hypothetical protein  48.56 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0518  hypothetical protein  54.3 
 
 		 152 aa  179  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39511  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07816  hypothetical protein  36.59 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.32 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  27.13 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.18 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  29.07 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  27.91 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.42 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  27.33 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  25.4 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  24.02 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  27.14 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  27.81 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.16 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  27.86 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  27.65 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.65 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.45 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  28.14 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  25.39 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  29.2 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  26.8 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  23.04 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  27.06 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  25 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  25.4 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  24.08 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  28.21 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  27.33 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1050  hypothetical protein  27.94 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  24.87 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  26.26 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  24.87 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24.08 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  24.37 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.47 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.01 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  28.66 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  25.52 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  24.34 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  24.87 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  25.67 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  22.68 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.34 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  24.48 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5124  flavin reductase-like, FMN-binding  26.95 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.178532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  24.87 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  24.87 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  27.65 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  25.15 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  28.03 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0361  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.92 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  25 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  24.48 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  25.13 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  25 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  23.2 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  24.48 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  27.5 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  27.33 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  25.13 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  24 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  21.88 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  24.59 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  23.47 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  24.12 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  23.28 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  24.34 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  23.81 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  27.75 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  27.17 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  23.56 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  22.75 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1499  FMN-binding protein  27.14 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.23332  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  24.42 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  23.66 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  25 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3465  hypothetical protein  27.03 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3110  hypothetical protein  27.03 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0966495  normal  0.11855 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  22.56 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  24.58 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0420  hypothetical protein  25.71 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0595779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  27.41 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  27.17 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06060  conserved hypothetical protein  28.24 
 
 		 155 aa  47.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  22.14 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  25.49 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  22.73 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24.76 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2070  hypothetical protein  27.68 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.224794 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  26.16 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.67 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.08 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>