162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00650 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  100 
 
 
194 aa  404  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.8 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  32.43 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  32.97 
 
 
188 aa  125  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.89 
 
 
190 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
200 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
190 aa  121  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  36.56 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  32.24 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.43 
 
 
190 aa  115  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  29.51 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  32.79 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  32.6 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  30.81 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  30 
 
 
192 aa  112  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.89 
 
 
190 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.72 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.57 
 
 
189 aa  106  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.02 
 
 
187 aa  105  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.95 
 
 
195 aa  105  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  29.89 
 
 
189 aa  105  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.91 
 
 
195 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.17 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.52 
 
 
186 aa  94.7  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  28.31 
 
 
200 aa  94.7  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  29.67 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  27.72 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  27.72 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  34.08 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  27.13 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  26.49 
 
 
190 aa  88.6  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  35.04 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  30.9 
 
 
186 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  32.78 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.88 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  27.47 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.61 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.42 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.82 
 
 
197 aa  72  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  28.29 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  32.58 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  30.34 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.7 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.03 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  24.05 
 
 
204 aa  62  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2559  hypothetical protein  24.56 
 
 
183 aa  61.6  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06060  conserved hypothetical protein  25.17 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  26.11 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.52 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  26.72 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.22 
 
 
295 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  30.28 
 
 
162 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  25.93 
 
 
221 aa  56.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 
176 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  27.46 
 
 
228 aa  55.1  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.61 
 
 
223 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  26.56 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  28.91 
 
 
149 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  21.47 
 
 
220 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  24.69 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  22.84 
 
 
213 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  28.39 
 
 
244 aa  52.4  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  26.12 
 
 
220 aa  52  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  28.91 
 
 
149 aa  52  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  26.39 
 
 
178 aa  52  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  28.28 
 
 
164 aa  52  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.52 
 
 
176 aa  52  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  24.26 
 
 
152 aa  52  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  25.31 
 
 
196 aa  51.2  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  22.29 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.21 
 
 
180 aa  51.2  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.3 
 
 
294 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  24 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  26.72 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.25 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  21.08 
 
 
292 aa  50.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  26.62 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  22.29 
 
 
207 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0420  hypothetical protein  23.9 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0595779  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1499  FMN-binding protein  22.64 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.23332  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.69 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.05 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.09 
 
 
193 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.87 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  30.25 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  30.23 
 
 
177 aa  48.9  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33014  predicted protein  26.83 
 
 
436 aa  49.3  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111303  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.09 
 
 
225 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.41 
 
 
180 aa  48.9  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  37.14 
 
 
180 aa  48.9  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  23.88 
 
 
219 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  20.54 
 
 
206 aa  48.5  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  29.01 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  28.39 
 
 
236 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0076  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  26.21 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208777  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  23.32 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  27.45 
 
 
180 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0361  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.49 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  20.48 
 
 
209 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>