168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0678 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  100 
 
 
184 aa  380  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  50.29 
 
 
185 aa  191  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  48.26 
 
 
189 aa  181  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.67 
 
 
186 aa  175  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  48.84 
 
 
186 aa  170  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  47.09 
 
 
186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.35 
 
 
186 aa  160  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.49 
 
 
185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  42.13 
 
 
216 aa  150  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  48.09 
 
 
165 aa  145  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.86 
 
 
215 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.14 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  41.62 
 
 
188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  38.86 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  36.36 
 
 
189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  36.93 
 
 
189 aa  115  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.52 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  36 
 
 
188 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  36 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.08 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.29 
 
 
189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.14 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  35.43 
 
 
191 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.71 
 
 
190 aa  102  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.13 
 
 
192 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  33.73 
 
 
190 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  35.43 
 
 
190 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  32.11 
 
 
209 aa  97.8  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  32.14 
 
 
200 aa  96.3  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  32.73 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.14 
 
 
189 aa  94.7  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.92 
 
 
195 aa  94.7  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.7 
 
 
195 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.8 
 
 
186 aa  88.2  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  32.72 
 
 
195 aa  85.1  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  27.12 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.82 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.78 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  31.69 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.08 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  30.28 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  31.9 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  33.33 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  33.33 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.87 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 
192 aa  67.8  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.54 
 
 
195 aa  67  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  32.11 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.77 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  26.09 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  27.46 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  26.19 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  29.48 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  25.75 
 
 
192 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.14 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.01 
 
 
160 aa  63.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  28.14 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  28.14 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.09 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.68 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.68 
 
 
225 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  25.35 
 
 
199 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  29.03 
 
 
220 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  28.93 
 
 
220 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  29.57 
 
 
180 aa  58.2  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  28.37 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  23.49 
 
 
194 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24.1 
 
 
194 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2559  hypothetical protein  24.1 
 
 
183 aa  57.8  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.19 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.58 
 
 
223 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  24.43 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  26.47 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  26.47 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  26.95 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  26.32 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  30.36 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.94 
 
 
192 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  27.54 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  27.34 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  24.06 
 
 
184 aa  55.5  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  27.06 
 
 
192 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.43 
 
 
176 aa  55.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  26.43 
 
 
219 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  30.36 
 
 
185 aa  54.3  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  26.92 
 
 
176 aa  54.7  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  39.47 
 
 
149 aa  54.7  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  39.47 
 
 
149 aa  54.7  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  28.57 
 
 
180 aa  54.3  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  27.48 
 
 
185 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.34 
 
 
215 aa  53.9  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  26 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  26.87 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  27.27 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.69 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.93 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  25.71 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  26.47 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  29.5 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>