More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1443 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  81.48 
 
 		 189 aa  323  9e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  78.19 
 
 		 189 aa  318  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  78.72 
 
 		 190 aa  315  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  77.13 
 
 		 188 aa  315  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  72.87 
 
 		 189 aa  302  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  60.64 
 
 		 194 aa  255  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  59.57 
 
 		 189 aa  249  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  59.26 
 
 		 190 aa  248  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  60.43 
 
 		 188 aa  248  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  60.43 
 
 		 200 aa  246  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  58.73 
 
 		 190 aa  245  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  58.51 
 
 		 192 aa  244  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  58.51 
 
 		 189 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  56.68 
 
 		 191 aa  237  8e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.45 
 
 		 190 aa  234  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  56.91 
 
 		 190 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  54.79 
 
 		 190 aa  224  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.13 
 
 		 195 aa  209  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  46.24 
 
 		 189 aa  197  7e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  39.01 
 
 		 209 aa  148  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  39.04 
 
 		 187 aa  144  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  37.23 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.9 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  39.78 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  38.41 
 
 		 200 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.63 
 
 		 186 aa  124  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  35.98 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.24 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  32.96 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.29 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  36.56 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  36 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  34.81 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.32 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  29.05 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  28.19 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  28.19 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.04 
 
 		 160 aa  84  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.29 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.88 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.57 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  32.86 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  28.29 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.28 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.13 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  28.68 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  29.63 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  30.67 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  28.03 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  32.06 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  28.26 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2559  hypothetical protein  24.71 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.68 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.14 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  28.34 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  30.06 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  25.44 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2037  hypothetical protein  27.89 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.902665  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  22.99 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  31.97 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  27.01 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.75 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  29.21 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.45 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.97 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  25.81 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  27.78 
 
 		 203 aa  62  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  31.29 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  31.29 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.93 
 
 		 223 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  29.5 
 
 		 168 aa  62  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.32 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.52 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  28.82 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  23.24 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.03 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.88 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  29.63 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  27.07 
 
 		 152 aa  60.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  30.61 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.67 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  25.47 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.41 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  36.7 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.77 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  28.41 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  29.7 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  27.61 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  26.38 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  23.56 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  27.07 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  31.58 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  26.85 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  34.62 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  29.93 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>