83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0726 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0726  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.06 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  31.68 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.03 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.82 
 
 
195 aa  63.9  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  28.57 
 
 
200 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  24.2 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  30.16 
 
 
177 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  26.81 
 
 
192 aa  61.6  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.03 
 
 
186 aa  60.5  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  25 
 
 
213 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  28.12 
 
 
178 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.47 
 
 
189 aa  58.2  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.18 
 
 
196 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  24.66 
 
 
183 aa  56.6  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  25.18 
 
 
196 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.03 
 
 
195 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0723  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  26.87 
 
 
170 aa  54.3  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  27.82 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  30 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  28.1 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  28.68 
 
 
205 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  27.73 
 
 
244 aa  50.4  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  27.34 
 
 
200 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.82 
 
 
215 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  24.52 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  25.56 
 
 
210 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  24.59 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  27.07 
 
 
221 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  23.57 
 
 
210 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.73 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.12 
 
 
176 aa  48.5  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.36 
 
 
186 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  24.41 
 
 
177 aa  47.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  26.56 
 
 
186 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.24 
 
 
190 aa  47.8  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.34 
 
 
186 aa  47.4  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  22.9 
 
 
164 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  27.94 
 
 
208 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  26.98 
 
 
176 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  27.27 
 
 
189 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  22.41 
 
 
197 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0401  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  19.86 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  31.36 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  26.19 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  25.98 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  27.84 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.08 
 
 
190 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.94 
 
 
189 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  22.46 
 
 
208 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  23.08 
 
 
190 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  27.21 
 
 
205 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  26.61 
 
 
191 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.21 
 
 
192 aa  45.1  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  24.06 
 
 
178 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  24.81 
 
 
190 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0001  flavin reductase domain-containing protein  28.35 
 
 
171 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117623  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  23.08 
 
 
209 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  29.84 
 
 
185 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  23.53 
 
 
202 aa  44.3  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.71 
 
 
186 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.11 
 
 
203 aa  43.9  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.11 
 
 
203 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  21.94 
 
 
195 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1255  flavin reductase domain-containing protein  22.79 
 
 
216 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  23.08 
 
 
186 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0224  FMN-binding protein  25.17 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114733  normal  0.756324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  22.14 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.43 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  23.7 
 
 
189 aa  42.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  22.98 
 
 
189 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  21.24 
 
 
185 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.3 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  22.36 
 
 
189 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  17.69 
 
 
199 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.28 
 
 
216 aa  41.6  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  30.08 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  23.74 
 
 
204 aa  41.2  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0420  hypothetical protein  24.32 
 
 
199 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0595779  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  29.27 
 
 
189 aa  40.8  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  29.27 
 
 
189 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  29.27 
 
 
189 aa  40.8  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  28.46 
 
 
189 aa  40.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>