More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0994 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0994  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
173 aa  345  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  48.41 
 
 
164 aa  128  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  38.85 
 
 
188 aa  124  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  40.67 
 
 
191 aa  124  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
188 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  37.5 
 
 
204 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
188 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.83 
 
 
160 aa  120  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  39.52 
 
 
171 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  38.22 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.52 
 
 
162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  43.62 
 
 
156 aa  117  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  40.74 
 
 
172 aa  117  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  37.74 
 
 
187 aa  117  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  42.5 
 
 
171 aa  117  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  43.12 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  41.46 
 
 
168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  43.12 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  43.12 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  34.97 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  43.12 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  42.95 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  43.12 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  43.12 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  43.12 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  41.56 
 
 
306 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  42.95 
 
 
170 aa  114  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  41.25 
 
 
179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.88 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.79 
 
 
174 aa  114  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  40 
 
 
408 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  39.51 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  41.83 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  38.1 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 
158 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  39.74 
 
 
180 aa  112  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.02 
 
 
330 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  34.97 
 
 
193 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  42.04 
 
 
161 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.67 
 
 
170 aa  111  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  42.68 
 
 
161 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  42.04 
 
 
161 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.58 
 
 
169 aa  110  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  40 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  41.4 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  39.1 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.79 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  40.51 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  41.94 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  34.39 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.87 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  40.79 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  40.62 
 
 
191 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  39.18 
 
 
174 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  38.27 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  38.46 
 
 
311 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.67 
 
 
155 aa  108  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  40.26 
 
 
161 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  33.74 
 
 
169 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1536  flavin reductase-like, FMN-binding protein  41.61 
 
 
163 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1559  flavin reductase domain-containing protein  41.61 
 
 
163 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426657  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5310  flavoprotein oxidoreductase  39.51 
 
 
181 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00829883  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  39.16 
 
 
169 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  41.1 
 
 
172 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  41.1 
 
 
172 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  38.75 
 
 
169 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
393 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.56 
 
 
170 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.71 
 
 
311 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  34.84 
 
 
169 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.91 
 
 
171 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.33 
 
 
190 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.41 
 
 
259 aa  106  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  39.16 
 
 
172 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 
161 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  37.93 
 
 
175 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1781  flavin reductase-like, FMN-binding protein  41.86 
 
 
179 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  39.38 
 
 
166 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  39.61 
 
 
161 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  36.31 
 
 
202 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  39.35 
 
 
161 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 
161 aa  104  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  39.35 
 
 
161 aa  104  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  38.31 
 
 
161 aa  104  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.67 
 
 
155 aa  104  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  42.41 
 
 
169 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  42.41 
 
 
169 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 
172 aa  104  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.12 
 
 
311 aa  103  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  42.14 
 
 
169 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  42.41 
 
 
169 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  42.14 
 
 
169 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  38.41 
 
 
327 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  42.14 
 
 
169 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  38.31 
 
 
161 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  38.82 
 
 
174 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3051  flavin reductase domain-containing protein  42.28 
 
 
166 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  39.1 
 
 
175 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.12 
 
 
169 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  42.04 
 
 
173 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>