More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1643 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1643  flavin reductase-like protein  100 
 
 		 170 aa  342  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  46.63 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2731  flavin reductase-like domain-containing protein  45.18 
 
 		 164 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.066131  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  41.01 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.17 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.87 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2008  hypothetical protein  38.06 
 
 		 160 aa  95.1  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2464  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.64 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1919  flavin reductase-like, FMN-binding  30.92 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0388  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.56 
 
 		 159 aa  92  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  39.39 
 
 		 327 aa  90.5  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3504  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.72 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.507811  normal  0.0756522 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2602  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.72 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  32.24 
 
 		 156 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3170  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.6 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.51 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  30.34 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.64 
 
 		 330 aa  85.1  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  35.71 
 
 		 318 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.56 
 
 		 227 aa  84  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  35.17 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  38.18 
 
 		 430 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  35.29 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0873  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.57 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000143727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.12 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.41 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.4 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.89 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  34.11 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  30.94 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  32.14 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.1 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2289  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  34.13 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  33.76 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0001  flavin reductase domain-containing protein  30.61 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117623  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  32.45 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  36.51 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  31.65 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  31.65 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.59 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  31.65 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  30.83 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.41 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  38.17 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1255  flavin reductase domain-containing protein  29.69 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  32.62 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.46 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4001  flavin reductase domain-containing protein  32.58 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.371931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  34.55 
 
 		 346 aa  77.4  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  32.65 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  33.86 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  35 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  36 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.36 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  30.22 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0319  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.51 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.42584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.18 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  30.34 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  30.56 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.58 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  32.82 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  37.1 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  34.65 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.21 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3609  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.93 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0867799  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  31.82 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  33.1 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.52 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  33.58 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.33 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  32.86 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  30.37 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  31.13 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5343  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.93 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.53 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  30.83 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3119  flavin reductase-like, FMN-binding  28.28 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0693  flavin reductase domain-containing protein  36.17 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5758  flavin reductase domain-containing protein  38.02 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  28.97 
 
 		 149 aa  72  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  30.83 
 
 		 193 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  32.06 
 
 		 311 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.45 
 
 		 575 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  32.59 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1114  hypothetical protein  28.67 
 
 		 160 aa  72  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  32.09 
 
 		 169 aa  72  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  29.66 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.87 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  33.06 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  30.87 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  30.37 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  30.37 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1364  hypothetical protein  28.47 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09651  hypothetical protein  30.22 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.66 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>